[发明专利]一种基于菠菜绿RNA可视化的方法及其应用有效

专利信息
申请号: 202010997682.3 申请日: 2020-09-21
公开(公告)号: CN112280798B 公开(公告)日: 2023-01-10
发明(设计)人: 洪益国;俞志明 申请(专利权)人: 杭州师范大学
主分类号: C12N15/82 分类号: C12N15/82;C12N15/11;G01N21/64
代理公司: 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 代理人: 沈渊琪
地址: 311121 浙江省杭*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 菠菜 rna 可视化 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.植物tRNA在保护和/或稳定菠菜绿RNA适配体与荧光素分子DFHBI相互作用并实现菠菜绿RNA在植物体内可视化的应用,所述植物tRNA为赖氨酸转运RNA,具体为赖氨酸转运RNA-菠菜绿RNA-赖氨酸转运RNA,所述赖氨酸转运RNA-菠菜绿RNA-赖氨酸转运RNA核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。

2.一种基于菠菜绿RNA可视化的方法,其特征在于包括以下步骤:

1)构建赖氨酸转运RNA-菠菜绿RNA-赖氨酸转运RNA即KSK,具体为:直接合成5’端含有Age I,3’端含有Sma I酶切位点序列的KSK片段,克隆赖氨酸转运RNA和菠菜绿RNA,构建赖氨酸转运RNA-菠菜绿RNA-赖氨酸转运RNA,赖氨酸转运RNA核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,菠菜绿RNA核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,赖氨酸转运RNA-菠菜绿RNA-赖氨酸转运RNA核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;

2)将KSK亚克隆至pEAQ-HT载体中,得到pEAQ-HT/KSK,其核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;

3)采用基因枪法将pEAQ-HT/KSK攻击至无叶绿体的洋葱表皮细胞中,与DFHBI相互作用,在激光共聚焦显微镜下观察,具体为:采用基因枪法将pEAQ-HT/KSK攻击至无叶绿体的洋葱表皮细胞中,将洋葱表皮放置在高渗培养基上,轰击12小时后,将洋葱表皮浸润至100-200µM DFHBI溶液中30min,然后在激光共聚焦显微镜下观察到足够强的绿色荧光;

所述基因枪法具体为:采用QIAprep Spin Miniprep Kit试剂盒,提取pEAQ-HT/KSK质粒,浓缩后调至终浓度为1µg/µl,制备包裹pEAQ-HT/KSK质粒的金粉,空气中干燥,再加入30µl无水乙醇,取10µl金粉加至载样膜上,利用基因枪系统进行轰击,所述包裹质粒的金粉制备方法为:称取1.5mg直径为1µm的金粉,用70%乙醇洗涤一次,用100%乙醇洗涤两次,快速离心去上清后,获得洗净的金粉,空气中干燥,加50µl的50%甘油悬浮,然后依次加入10µgpEAQ-HT/KSK质粒,50µl浓度为2.5M的CaCl2溶液,20µl的0.1M的亚精胺,以及250µl的70%乙醇,每加入一样试剂均剧烈涡旋2-3秒,待所有试剂加完后,快速离心,去除上清,沉淀即为包裹质粒的金粉。

3.如权利要求2所述的一种基于菠菜绿RNA可视化的方法,其特征在于所述高渗培养基包括:含0.8%植物凝胶的1/2 MS固体培养基,pH=5.8,内含46.67g/L山梨醇,46.67g/L甘露醇。

4.如权利要求2所述的一种基于菠菜绿RNA可视化的方法,其特征在于所述DFHBI溶液浓度为:100µM。

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