[发明专利]分子特征的提取及三维定量构效关系的计算方法及装置

权利要求书

1.一种分子特征的提取方法，其特征在于，包括：

获取分子的第一特征矩阵，所述第一特征矩阵用以表征所述分子的初始特征维度以及原子数目；

根据所述第一特征矩阵以及预设图卷积神经网络模型，生成所述分子的第二特征矩阵；所述第二特征矩阵用以表征所述分子的第一特征维度以及原子数目；

根据预设正方体像素模型以及所述第二特征矩阵，生成第三特征矩阵，所述第三特征矩阵用以表征所述分子中各原子在空间坐标系的坐标信息以及第一特征维度；

根据所述第三特征矩阵以及预设三维图卷积神经网络模型，生成第四特征矩阵，所述第四特征矩阵用以表征所述分子中各原子在空间坐标系的坐标信息以及第二特征维度；

根据所述第三特征矩阵以及所述第四特征矩阵，计算生成用以表征所述分子特征的第五特征矩阵；或

根据所述第四特征矩阵，计算生成用以表征所述分子特征的第五特征矩阵。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述获取分子的第一特征矩阵，具体包括：

获取分子中的多个原子及原子数目；

根据预设编码方式将各原子编码，生成各原子对应的编码向量；

根据各编码向量，确定分子的初始特征维度；

根据所述原子数目以及初始特征维度，确定所述分子的第一特征矩阵。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据预设正方体像素模型以及所述第二特征矩阵，生成第三特征矩阵的步骤中，包括：

将所述预设正方体像素模型划分为多个三维像素；

当所述原子在所述三维像素的中心时，将所述原子填充至所述三维像素，并确定所述原子在空间坐标系的坐标信息。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括：

根据第一维度参数确定所述第一特征维度，根据第二维度参数确定第二特征维度。

5.一种分子三维定量构效关系的计算方法，其特征在于，包括：

获取分子的计算层次参数；

根据所述计算层次参数确定分子的目标特征矩阵，所述目标特征矩阵是通过多个计算单元生成的，所述计算单元用于执行如权利要求1-4任一项所述的分子特征的提取方法；

根据预设的全联接层函数，将所述目标特征矩阵转换为一维特征矩阵；

根据所述一维特征矩阵，计算生成所述分子的三维定量构效关系值。

6.一种分子特征的提取装置，其特征在于，包括：

第一特征矩阵获取模块，用于获取分子的第一特征矩阵，所述第一特征矩阵用以表征所述分子的初始特征维度以及原子数目；

第二特征矩阵获取模块，用于根据所述第一特征矩阵以及预设图卷积神经网络模型，生成所述分子的第二特征矩阵；所述第二特征矩阵用以表征所述分子的第一特征维度以及原子数目；

第三特征矩阵获取模块，用于根据预设正方体像素模型以及所述第二特征矩阵，生成第三特征矩阵，所述第三特征矩阵用以表征所述分子中各原子在空间坐标系的坐标信息以及第一特征维度；

第四特征矩阵获取模块，用于根据所述第三特征矩阵以及预设三维图卷积神经网络模型，生成第四特征矩阵，所述第四特征矩阵用以表征所述分子中各原子在空间坐标系的坐标信息以及第二特征维度；

第五特征矩阵获取模块，用于根据所述第三特征矩阵以及所述第四特征矩阵，计算生成用以表征所述分子特征的第五特征矩阵；或根据所述第四特征矩阵，计算生成用以表征所述分子特征的第五特征矩阵。

7.一种分子三维定量构效关系的计算装置，其特征在于，包括：

计算层次参数获取模块，用于获取分子的计算层次参数；

目标特征矩阵确定模块，用于根据所述计算层次参数确定分子的目标特征矩阵，所述目标特征矩阵是通过多个计算单元生成的，所述计算单元用于执行如权利要求1-4任一项所述的分子特征的提取方法；

转换模块，用于根据预设的全联接层函数，将所述目标特征矩阵转换为一维特征矩阵；

计算模块，用于根据所述一维特征矩阵，计算生成所述分子的三维定量构效关系值。