[发明专利]一种利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法在审
申请号: | 202011036348.8 | 申请日: | 2020-09-27 |
公开(公告)号: | CN114277116A | 公开(公告)日: | 2022-04-05 |
发明(设计)人: | 段志峰 | 申请(专利权)人: | 广州源古纪科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869;G16B20/50;G16B20/20 |
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地址: | 510507 广东省广州市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 全外显子测序 检测 基因 遗传病 方法 | ||
1.一种利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1、基因组DNA提取:采用试剂盒及标准DNA提取方法提取基因组DNA;
S2、基因捕获:基因组DNA经DNA切割仪切割、末端修复、接头连接、PCR扩增、杂交捕获;
S3、测序:高通量测序采用Illumina HiSeq平台进行全外显子测序;
S4、数据分析:分析测序结果,包括测序深度、测序长度、测序总量;
S5、筛选:变异采用软件进行注释,使用数据库进行已知或疑似致病突变筛选,并对每个变异进行分类;
S6、检测结果解读:选用人类表型标准术语或人类在线孟德尔遗传数据库术语筛选致病基因。
2.根据权利要求1所述的利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法,其特征在于,所述步骤S1采用的试剂盒为QIAamp DNA Blood Mini Kit 50次提取试剂盒。
3.根据权利要求1所述的利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法,其特征在于,步骤S2中杂交捕获所采用的试剂为xGen Exome Research Panel v1。
4.根据权利要求1所述的利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法,其特征在于,步骤S2中基因组DNA经DNA切割仪切割得到的为180-200bp的片段。
5.根据权利要求1所述的利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法,其特征在于,步骤S2中PCR扩增条件为:95℃5min;98℃20s,60℃5mim,10~12个循环;得到的扩增产物4℃保存。
6.根据权利要求1所述的利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法,其特征在于,步骤S3测序过程中目标区域平均测序深度200~220X。
7.根据权利要求1所述的利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法,其特征在于,步骤S4所述的数据库为在线孟德尔遗传数据库和人类基因突变数据库。
8.根据权利要求1所述的利用全外显子测序检测单基因遗传病的方法,其特征在于,步骤S6之后还包括步骤:用sanger测序对全基因组外显子测序结果进行验证。
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