[发明专利]一种辣椒番茄斑点萎蔫病毒病抗性基因相关的SNP标记及其特异性引物和应用

权利要求书

1.一组检测辣椒番茄斑点萎蔫病毒病抗性基因相关的SNP标记的KASP引物组，其特征在于，所述引物组由序列分别如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的前引物A1、前引物A2和一条序列如SEQ ID NO.4所示的后引物组成；所述SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述SNP标记在SEQ ID NO.1所示序列的第21位的碱基为A或G；所述前引物A1和前引物A2的5’端分别加有不同的荧光标签序列。

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述前引物A1的5’端加有FAM荧光标签序列，所述前引物A2的5’端加有HEX荧光标签序列；所述FAM荧光标签序列为5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’，所述HEX荧光标签序列为5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’。

3.一种鉴定抗番茄斑点萎蔫病毒病的辣椒的检测试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中含有权利要求1-2中任一项所述的引物组。

4.如权利要求1-2中任一项所述的引物组或如权利要求3所述的检测试剂盒在鉴定抗番茄斑点萎蔫病毒病的辣椒中的应用，其特征在于，所述应用包括使用所述引物组或所述试剂盒检测辣椒番茄斑点萎蔫病毒病抗性基因相关的SNP标记的基因型，所述SNP标记在SEQ ID NO.1所示序列的第21位的碱基为A或G；

若待测辣椒的番茄斑点萎蔫病毒病抗性基因相关的SNP标记对应的SNP位点为G:G纯合基因型时，待测辣椒材料的番茄斑点萎蔫病毒病抗病性表型为感病；若待测辣椒的番茄斑点萎蔫病毒病抗性基因相关的SNP标记对应的SNP位点为A:A纯合基因型或A:G杂合基因型时，则待测辣椒材料的番茄斑点萎蔫病毒病抗病性表型为抗病。

5.一种对抗番茄斑点萎蔫病毒病的辣椒的鉴定方法，其特征在于，该鉴定方法为：使用权利要求1所述的引物组对待测辣椒材料进行番茄斑点萎蔫病毒病抗性的鉴定；

鉴定步骤具体包括：

以待测辣椒的基因组DNA作为模板，使用所述引物组检测辣椒番茄斑点萎蔫病毒病抗性基因相关的SNP标记的基因型，所述SNP标记在SEQ ID NO.1所示序列的第21位的碱基为A或G，采用所述引物组进行PCR扩增，并将得到的扩增产物进行荧光信号扫描，并对扫描数据进行分析后，并根据分析结果按照以下方法判定待测辣椒的表型：

若待测辣椒的番茄斑点萎蔫病毒病抗性基因相关的SNP标记对应的SNP位点为G:G纯合基因型时，待测辣椒材料的番茄斑点萎蔫病毒病抗病性表型为感病；

若待测辣椒的番茄斑点萎蔫病毒病抗性基因相关的SNP标记对应的SNP位点为A:A纯合基因型或A:G杂合基因型时，则待测辣椒材料的番茄斑点萎蔫病毒病抗病性表型为抗病。