[发明专利]一种鉴定丝羽乌骨鸡和竹丝鸡的分子标记及应用

说明书

本发明公开了一种鉴定丝羽乌骨鸡和竹丝鸡的分子标记及应用。所述分子标记为位于线粒体基因组14945bp处的SNP位点，其存在A/G多态性，当该位置碱基为A时，为竹丝鸡，当该位置碱基为G时，为丝羽乌骨鸡。利用引物SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2对含有所述分子的基因片段进行扩增，然后用限制性内切酶HpaI酶切扩增产物，获得一条690bp扩增片段的为竹丝鸡，获得540bp和150bp两条扩增片段的为丝羽乌骨鸡。本方法操作简便，结果可靠。采用本发明的方法能够快速、准确鉴别丝羽乌骨鸡和竹丝鸡，该法易于操作，费用低，便于基层推广和使用，具有广阔的市场应用前景。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，尤其涉及一种鉴定丝羽乌骨鸡和竹丝鸡的分子标记及应用。

背景技术

丝羽乌骨鸡是我国最古老鸡品种之一，有史料记载可追溯到13世纪，也是我国少数被列为国际标准品种之一。丝羽乌骨鸡外貌与其他鸡种明显不同，具有“桑葚冠、樱头、绿耳、胡须、丝羽、五爪、毛脚、乌皮、乌骨和乌肉”等标准的“十全”特征，具有重要的的观赏功能。同时丝羽乌骨鸡还具有药用功能，是中医医治妇科病药“乌鸡白凤丸”的主要原料。

由于丝羽乌骨鸡生长速度很慢，90天只能达到1.0kg左右，每年产蛋不到100枚，因此相关产品价格很高。竹丝鸡是在丝羽乌骨鸡基础上，导入外血，进行杂交，培育而成，体型外貌与丝羽乌骨鸡相似，90天可达1.7kg以上，同时父母代母鸡产蛋也大大提高，66周龄产蛋，由纯种丝羽乌骨鸡100枚不到提高到180枚以上，因此苗鸡成本也大大降低。由于苗鸡成本和生长速度等优势，造成最终上市的竹丝鸡的价格要比丝羽乌骨鸡低很多。

丝羽乌骨鸡和竹丝鸡，虽然外形相似，品质还是存在一定的差异，一般消费者仅仅靠外观，难以分辨真假。“一种鉴定泰和乌骨鸡特异性的分子标记”(201610748925.3)，虽然可以区分丝羽乌骨鸡和其他非丝羽乌骨鸡，但是不能区分含有丝羽乌骨鸡血缘的竹丝鸡。因此亟需一种快速、准确而又易于操作的技术鉴别丝羽乌骨鸡和竹丝鸡，保证我国丝羽乌骨鸡行业有序、健康、稳定发展，满足人民多元化的家禽产品需求。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。由于SNP具有高密度性、兼容性好、通量高、速度快、成本低与表型性状关联度高等优点，因此作为一类农作物和家养动物的分子标记，SNP在品种DNA身份鉴定中得到了广泛的应用。迄今为止，未见利用SNP分子标记方法对丝羽乌骨鸡和竹丝鸡进行鉴定的研究报道。

发明内容

本发明的目的之一在于针对现有技术不足，提供一种鉴定丝羽乌骨鸡和竹丝鸡的分子标记。

本发明的目的之二在于提供用于检测上述分子标记的引物。

本发明的目的之三在于提供上述分子标记的用途。

本发明的目的之四在于提供利用上述分子标记的检测方法。

本发明的目的通过以下技术方案实现：

一种鉴别丝羽乌骨鸡和竹丝鸡分子标记，所述分子标记为位于线粒体基因组14945bp处的SNP位点，其存在A/G多态性，当该位置碱基为A时，为竹丝鸡，当该位置碱基为G时，为丝羽乌骨鸡。

一种鉴别丝羽乌骨鸡和竹丝鸡的方法，为提取待检测品种鸡(血液、鸡肉、羽毛、组织、鸡蛋等均可)基因组DNA，检测线粒体基因组14945bp处的碱基序列，当该位置碱基为A时，为竹丝鸡，当该位置碱基为G为丝羽乌骨鸡。

一种鉴别丝羽乌骨鸡和竹丝鸡的方法，线粒体基因组14945bp处的碱基为G时，可以形成GTT/AAC的HpaI内切酶的酶切位点，碱基为A时ATTAAC无法被HpaI内切酶酶切。