[发明专利]用于单基因隐性遗传病检测的探针组,试剂盒,筛查方法及其应用在审

专利信息
申请号: 202011044906.5 申请日: 2020-09-28
公开(公告)号: CN112094900A 公开(公告)日: 2020-12-18
发明(设计)人: 张蕾 申请(专利权)人: 福州数据技术研究院有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6874
代理公司: 福州市景弘专利代理事务所(普通合伙) 35219 代理人: 池明霞;林祥翔
地址: 350000 福建省福州市*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 用于 基因 隐性 遗传病 检测 探针 试剂盒 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种用于单基因隐性遗传病检测的探针组,其特征在于:所述探针组依据164个基因共3343个捕获区域设计获得,所述的捕获区域如下所示:

2.一种用于单基因隐性遗传病检测的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有如权利要求1所述的探针组。

3.一种单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:采用权利要求1所述的探针组进行检测。

4.根据权利要求3所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:所述基因筛查方法具体包括以下步骤:

(1)样品采集与提取:收集待测样品,提取基因组DNA;

(2)DNA片段化:将所述基因组DNA超声打断或者酶切至100~500bp的DNA片段;

(3)末端修复/dA尾添加与接头连接:对所述DNA片段进行末端修复/dA尾添加与接头连接得到产物,对所述产物进行纯化;

(4)杂交前扩增:将步骤(3)中的纯化产物进行PCR扩增富集、纯化,获得用于杂交捕获的DNA文库;

(5)第一次探针捕获:将所述DNA文库进行杂交前封闭,采用所述探针组进行杂交捕获;

(6)目标区域富集:将第一次探针捕获产物进行洗脱,获得捕获的靶序列,将所述捕获的靶序列进行PCR扩增,获得富集的靶序列;

(7)第二次探针捕获与目标区域富集:将富集的靶序列作为第二次探针捕获的DNA文库,重复步骤(5)和步骤(6),对第二次目标区域富集获得富集的靶序列进行纯化,获得待测序产物;以及

(8)测序及分析:将所述待测序产物进行二代测序,采用生物信息学分析测序结果。

5.根据权利要求4所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:在步骤(1)中,所述待测样品为血斑、血液或口腔黏膜细胞。

6.根据权利要求4所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:在步骤(3)中,所述接头为Y型接头,所述Y型接头包括第一序列和第二序列,所述第一序列如SEQ ID NO.1所示,所述第二序列如SEQ ID NO.2所示。

7.根据权利要求4所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:在步骤(4)中,所述纯化为磁珠纯化;所述PCR扩增富集的体系为:

纯化产物14.5μL;2×高保真热启动预混液17.5μL;和标签引物混合液3μL;

所述标签引物的正向序列如SEQ ID NO.3所示,反向序列如SEQ ID NO.4所示;

所述PCR扩增富集的反应条件为:

98℃预变性45s;98℃变性15sec,60℃退火30sec,72℃延伸30sec,循环12次;72℃最终延伸1min;4℃保温。

8.根据权利要求4所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:在步骤(6)中,所述PCR扩增的体系为:

捕获的靶序列20μL;2×高保真热启动预混液25μL;和文库扩增引物-TS混合液5μL;

所述PCR扩增富集的反应条件为:

98℃预变性45s;98℃变性15sec,60℃退火30sec,72℃延伸30sec,循环8次;72℃最终延伸1min;4℃保温。

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