[发明专利]用于单基因隐性遗传病检测的探针组,试剂盒,筛查方法及其应用在审
申请号: | 202011044906.5 | 申请日: | 2020-09-28 |
公开(公告)号: | CN112094900A | 公开(公告)日: | 2020-12-18 |
发明(设计)人: | 张蕾 | 申请(专利权)人: | 福州数据技术研究院有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6874 |
代理公司: | 福州市景弘专利代理事务所(普通合伙) 35219 | 代理人: | 池明霞;林祥翔 |
地址: | 350000 福建省福州市*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 基因 隐性 遗传病 检测 探针 试剂盒 方法 及其 应用 | ||
1.一种用于单基因隐性遗传病检测的探针组,其特征在于:所述探针组依据164个基因共3343个捕获区域设计获得,所述的捕获区域如下所示:
2.一种用于单基因隐性遗传病检测的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有如权利要求1所述的探针组。
3.一种单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:采用权利要求1所述的探针组进行检测。
4.根据权利要求3所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:所述基因筛查方法具体包括以下步骤:
(1)样品采集与提取:收集待测样品,提取基因组DNA;
(2)DNA片段化:将所述基因组DNA超声打断或者酶切至100~500bp的DNA片段;
(3)末端修复/dA尾添加与接头连接:对所述DNA片段进行末端修复/dA尾添加与接头连接得到产物,对所述产物进行纯化;
(4)杂交前扩增:将步骤(3)中的纯化产物进行PCR扩增富集、纯化,获得用于杂交捕获的DNA文库;
(5)第一次探针捕获:将所述DNA文库进行杂交前封闭,采用所述探针组进行杂交捕获;
(6)目标区域富集:将第一次探针捕获产物进行洗脱,获得捕获的靶序列,将所述捕获的靶序列进行PCR扩增,获得富集的靶序列;
(7)第二次探针捕获与目标区域富集:将富集的靶序列作为第二次探针捕获的DNA文库,重复步骤(5)和步骤(6),对第二次目标区域富集获得富集的靶序列进行纯化,获得待测序产物;以及
(8)测序及分析:将所述待测序产物进行二代测序,采用生物信息学分析测序结果。
5.根据权利要求4所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:在步骤(1)中,所述待测样品为血斑、血液或口腔黏膜细胞。
6.根据权利要求4所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:在步骤(3)中,所述接头为Y型接头,所述Y型接头包括第一序列和第二序列,所述第一序列如SEQ ID NO.1所示,所述第二序列如SEQ ID NO.2所示。
7.根据权利要求4所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:在步骤(4)中,所述纯化为磁珠纯化;所述PCR扩增富集的体系为:
纯化产物14.5μL;2×高保真热启动预混液17.5μL;和标签引物混合液3μL;
所述标签引物的正向序列如SEQ ID NO.3所示,反向序列如SEQ ID NO.4所示;
所述PCR扩增富集的反应条件为:
98℃预变性45s;98℃变性15sec,60℃退火30sec,72℃延伸30sec,循环12次;72℃最终延伸1min;4℃保温。
8.根据权利要求4所述的单基因隐性遗传病的筛查方法,其特征在于:在步骤(6)中,所述PCR扩增的体系为:
捕获的靶序列20μL;2×高保真热启动预混液25μL;和文库扩增引物-TS混合液5μL;
所述PCR扩增富集的反应条件为:
98℃预变性45s;98℃变性15sec,60℃退火30sec,72℃延伸30sec,循环8次;72℃最终延伸1min;4℃保温。
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