[发明专利]一种基于环境DNA技术检测大型水生植物多样性的方法

权利要求书

1.一种检测待测水域大型水生植物多样性的方法，包括如下步骤：

1)采集待测水域的表层沉积物样本；

2)提取所述表层沉积物样本中的环境DNA；

3)用Rbcl引物对对所述环境DNA进行扩增，得到PCR产物；

所述Rbcl引物对为能够扩增由序列1和序列2组成引物对的扩增区域的引物对；

4)将所述PCR产物依次进行建库、测序、聚类和注释，确定所述待测水域大型水生植物物种组成和/或物种相对丰度，实现待测水域大型水生植物多样性检测。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：

所述Rbcl引物对由如下引物1和引物2组成：

所述引物1为如下a或b：

a、核苷酸序列为序列表中序列1的单链DNA分子；

b、将序列表中序列1所示的序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由(a)衍生的单链DNA分子；

所述引物2为如下c或d：

c、核苷酸序列为序列表中序列2的单链DNA分子；

d、将序列表中序列2所示的序列经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由(c)衍生的单链DNA分子。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于：

所述采集待测水域的表层沉积物样本为采集待测水域沉积物表层0-1cm的沉积物样品。

4.一种用于检测待测水域大型水生植物多样性的试剂盒，包括如下1)-3)：

1)权利要求1-3任一项中的所述Rbcl引物对或含有所述引物对的PCR试剂；

2)采集所述待测水域的表层沉积物的试剂和/或设备；

3)提取所述待测水域的表层沉积物中的环境DNA的试剂和/或设备。

5.权利要求4所述的试剂盒在检测待测水域大型水生植物多样性中的应用。

6.权利要求1-3任一项中的所述Rbcl引物对、采集所述待测水域表层沉积物的试剂和/或设备、提取所述待测水域表层沉积物中的环境DNA的试剂和/或设备在检测待测水域大型水生植物多样性中的应用。

7.权利要求4所述的试剂盒在制备检测待测水域大型水生植物多样性产品中的应用。

8.权利要求1-3任一项中的所述Rbcl引物对、采集所述待测水域表层沉积物的试剂和/或设备、提取所述待测水域表层沉积物的试剂和/或设备在制备检测待测水域大型水生植物多样性产品中的应用。

9.根据权利要求5所述的试剂盒或权利要求6-8任一所述的应用，其特征在于：所述待测水域的表层沉积物为待测水域沉积物表层0-1cm的沉积物样品。