[发明专利]一种PDGFRB易位性血液病的融合基因及其检测引物和应用

说明书

本发明涉及一种PDGFRB易位性血液病的融合基因，所述的融合基因由CSNK2A1外显子4和PDGFRB外显子12融合形成，CSNK2A1基因序列在GeneBank中的登录号为NM_177559.3，PDGFRB基因序列在GeneBank中的登录号为NM_002609.4；所述的融合基因包括SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。本发明发现了PDGFRB易位性血液病的新融合基因，并针对该融合基因设计了特异性的PCR引物，扩大了原有检测手段的检测范围，能够应用于临床，可提高诊断CSNK2A1‑PDGFRB易位性血液病的检出率和准确率，为诊断分型及分子靶向治疗提供依据。

技术领域

本发明具体涉及一种PDGFRB易位性血液病的融合基因及其检测引物和应用。

背景技术

骨髓增殖疾病是一类侵袭性血液恶性肿瘤，各年龄段均可发病，多数患者对传统化疗方案耐药，异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)是唯一对该类疾病有潜在治愈可能的措施。由于此类疾病发病率低，临床医生尚缺乏对该类疾病的深入认识，常误诊为其他血液肿瘤，如慢性粒单核细胞白血病(CMML)、不典型CML(aCML)、伴嗜酸细胞增多的T淋巴母细胞淋巴瘤和骨髓增生异常综合症(MDS)等。

PDGFRB重排阳性的MPN患者的临床及实验室特征如下：外周白细胞水平明显升高，常伴有嗜酸性粒细胞增多，骨髓穿刺显示髓系过度增生，阳性体征伴有浅表淋巴结肿大及肝脾肿大等。对PDGFRB基因重排的精确诊断将有助于提高对该类疾病的临床和生物学特征的认识和理解。

目前高通量测序是唯一可以明确未知易位位点的检测手段，然而高通量测序费用高昂，检测周期长，检测平台稀缺，对样品质量要求高，不利于普及推广，对于大多数患者来说也不是首选检测手段。依赖以往经验，针对已知的融合位点设计特异性的PCR引物组合，对肿瘤组织中提取出的RNA逆转录之后进行PCR扩增并测序，检测融合基因具体易位位点，是最准确、便捷、经济的方法。因此，发现新的致病融合位点，进而设计PCR引物将有利于PDGFRB易位性血液病检测准确度的进一步提高。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是提供一种PDGFRB易位性血液病的新融合基因及其检测引物和应用。

为解决以上技术问题，本发明采用如下技术方案：

本发明一方面提供一种PDGFRB易位性血液病的融合基因，所述的融合基因由CSNK2A1外显子4和PDGFRB外显子12融合形成。

优选地，所述的融合基因包括SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列，或与其具有80％以上同源性的核苷酸序列。

进一步优选地，所述的融合基因包括与SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列具有85％以上同源性的核苷酸序列，更进一步优选具有90％以上同源性，再进一步优选具有95％以上同源性，最优选具有98％以上同源性。

优选地，所述的CSNK2A1基因序列在GeneBank中的登录号为NM_177559.3。

优选地，所述的PDGFRB基因序列在GeneBank中的登录号为NM_002609.4。

该融合基因通过高通量测序技术在一例形态学符合PDGFRB重排阳性MPN的特征的PDGFRB易位性血液病病例中首次检测发现。

本发明第二方面提供一种上述PDGFRB易位性血液病的融合基因作为检测靶点在制备PDGFRB易位性血液病的诊断试剂中的应用。

本发明的第三方面提供一种检测上述PDGFRB易位性血液病的融合基因的PCR引物，一条引物以CSNK2A1外显子4为靶基因设计，另一条引物以PDGFRB外显子12为靶基因设计。所有能够检测本发明的融合基因的引物对均在本发明的保护范围内。