[发明专利]一种鉴定蜜蜂分化关键基因的方法及鉴定得到的基因和应用

权利要求书

1.一种鉴定蜜蜂分化关键基因的方法，其特征在于，包括：

获得多个蜜蜂96h幼虫的全基因组信息，通过三维基因组技术进行分析得到多个蜜蜂基因拓扑相关结构域，根据蜂王浆主蛋白家族成员在所述多个蜜蜂基因拓扑相关结构域的分布确定和蜜蜂分化相关的关键基因。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蜂王浆主蛋白家族成员包括：MRJP1、MRJP2、MRJP3、MRJP4、MRJP5、MRJP6、MRJP7、MRJP8和MRJP9。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述获得多个蜜蜂96h幼虫的全基因组信息为：

获得多个蜜蜂96h幼虫的组织，经过预处理、酶切、生物素标记、平末端连接及DNA纯化提取后得到Hi-C样本，使用所述Hi-C样本建立蜜蜂全基因信息文库并测序用于后续的三维基因组技术分析。

4.根据权利要求1或2所述方法，其特征在于，所述通过三维基因组技术进行分析得到多个蜜蜂基因拓扑相关结构域为使用80～100kb的分辨率对染色体进行bin的划分，后通过Insulation算法或directionality index算法鉴定TAD的边界得到多个蜜蜂基因拓扑相关结构域。

5.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述确定和蜜蜂分化相关的关键基因为：

统计蜂王浆主蛋白家族成员在所有拓扑相关结构域中的分布，确定所述蜂王浆主蛋白家族成员最多的拓扑相关结构域中的基因为和蜜蜂分化相关的关键基因。

6.权利要求1-5任一项所述方法在辅助蜜蜂级型分化中的应用。

7.L-木酮糖还原酶、LOC724335蛋白或LOC724286蛋白在鉴定分化为蜂王或者工蜂的蜜蜂幼虫中的应用，其特征在于，所述L-木酮糖还原酶含有如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，所述LOC724286蛋白含有如SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述LOC724335蛋白含有如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。

8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述应用为：

对蜜蜂幼虫的L-木酮糖还原酶进行检测，L-木酮糖还原酶表达量高的分化为蜂王，L-木酮糖还原酶表达量低的分化为工蜂；和/或，

对蜜蜂幼虫的LOC724286蛋白进行检测，LOC724286蛋白表达量高的分化为蜂王，LOC724335蛋白表达量低的分化为工蜂；和/或，

对蜜蜂幼虫的LOC724335蛋白进行检测，LOC724335蛋白表达量高的分化为工蜂，表达量低的分化为蜂王。

9.L-木酮糖还原酶、LOC724286蛋白或LOC724335蛋白在调控蜜蜂分化中的应用，其特征在于，所述L-木酮糖还原酶含有如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，所述LOC724286蛋白含有如SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列，所述LOC724335蛋白含有如SEQ ID NO:5和SEQ IDNO:6所示的氨基酸序列。

10.根据权利要求7或9所述的应用，其特征在于，编码所述L-木酮糖还原酶的基因包括如SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列，和/或，编码所述LOC724286蛋白的基因包括如SEQ IDNO:4所示的核苷酸序列，和/或，编码所述LOC724335蛋白的基因包括如SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列。