[发明专利]用于检测嗜麦芽糖寡养单胞菌的液相芯片及应用有效

专利信息
申请号: 202011082556.1 申请日: 2020-10-12
公开(公告)号: CN112592986B 公开(公告)日: 2022-05-10
发明(设计)人: 刘斌;王婧;郭玺;穆会乾 申请(专利权)人: 南开大学
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6837;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 代理人: 朱红星
地址: 300457 天津市滨*** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: 用于 检测 麦芽糖 寡养单胞菌 芯片 应用
【权利要求书】:

1.可用于连接在标记有不同荧光染料磁性微球上的DNA探针,其特征为:从嗜麦芽糖寡养单胞菌G6227、G6229、G6145、G6141、G6149、G6144的wzm基因中分别选取的一种DNA片段,其探针序列依次如SEQ ID NO: 1-6所示。

2.权利要求1所述可用于连接标记有不同荧光染料磁性微球上的任意1种或几种DNA探针在制备用于检测6种嗜麦芽糖寡养单胞菌中至少一种菌悬液芯片方面的应用。

3.含有权利要求1所述的DNA探针的悬液芯片制备方法,主要包含以下步骤:

(1)在嗜麦芽糖寡养单胞菌G6227、G6229、G6145、G6141、G6149、G6144的wzm基因内部,设计并制备用于多重PCR的DNA引物,每株细菌的引物包含上、下游引物各1对,且下游引物利用生物素基团进行标记;所述的引物序列依次如SEQ ID NO: 7-18所示;

(2)在嗜麦芽糖寡养单胞菌G6227、G6229、G6145、G6141、G6149、G6144的wzm基因内部设计并制备用DNA探针, 每株细菌的DNA探针在基因上的位置均位于对应的上、下游引物之间,每条DNA探针在5'末端均加入15个胸腺嘧啶核苷酸(dT)作为连接臂,并在连接臂末端加入氨基基团进行修饰,以便与带有羟基基团的标记有荧光染料的磁性微球进行偶联;

(3)利用步骤(2)的DNA探针与不同荧光染料磁性微球进行偶联;

(4)制备待检测样品的基因组DNA,利用步骤(1)制备的引物,进行多重PCR扩增;

(5)利用步骤(4)获得扩增产物与步骤(3)获得的偶联微球的DNA探针进行杂交和染色;

(6)将步骤(5)获得的染色后的杂交产物利用Bio-Plex 200悬液芯片系统进行检测。

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