[发明专利]一种基于纯DNA功能水凝胶的有害金属离子检测方法有效

专利信息
申请号: 202011086746.0 申请日: 2020-10-12
公开(公告)号: CN112941152B 公开(公告)日: 2023-06-23
发明(设计)人: 褚健;唐伟;陈春;李希建;于立冰;程梦茜;熊忠华 申请(专利权)人: 中国工程物理研究院材料研究所
主分类号: C12Q1/6816 分类号: C12Q1/6816;G01N21/33
代理公司: 成都众恒智合专利代理事务所(普通合伙) 51239 代理人: 王育信
地址: 621700 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 dna 功能 凝胶 有害 金属 离子 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种基于纯DNA功能水凝胶的有害金属离子检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤1:设计两条DNA单体序列E1链和S1链,分别包含目标金属离子的DNAzyme和酶切底物,并至少含有三段互补片段;所述目标金属离子为铅离子;所述两条DNA单体序列分别为:

S1链:

5’- TATCAGATTCGATTTTTT CACTAT/rA/GGAA GAGATGTTTTTGTCGGTAACCAG-3’;

E1链:

5’-TCGAATCTGATATTT TT CATCTCTTCTCCGA GCCG GTCGAA ATAGTGATTTTTCTGGTTACCGAC-3’;

步骤2:将设计的两条单体序列混合杂交制备纯DNA水凝胶;该步骤具体如下:

步骤2a:将两条单体序列各自按1.5 mM的理论浓度溶解于缓冲液中,并于35 ℃条件下充分溶解;所述缓冲液为含100 mM NaCl的50 mM HEPES缓冲液,pH为7.0;

步骤2b:采用微量核酸蛋白测定仪中的寡核苷酸分析程序标定真实浓度;

步骤2c:将经过定量的DNA序列,按照E1链与S1链摩尔比1:1,在统一规格的PCR管中,用缓冲液一步混合配制10 μL体积的终浓度为0.3~0.6 mM的DNA水凝胶;

步骤2d:将DNA水凝胶置于PCR仪中,首先升温至60~70 ℃并恒温,用漩涡混合仪将粘稠的DNA水凝胶混匀;

步骤2e:将DNA水凝胶重新置于PCR仪中,升温至65~75 ℃并恒温5 min,然后以0.45℃/min的速率降至10 ℃进行退火;

步骤2f:将制备好的DNA水凝胶置于室温保存;

步骤3:将目标金属离子溶液与制备的纯DNA水凝胶反应30 min~6 h,使DNA水凝胶骨架中特定的DNAzyme被激活并切断底物序列,破坏水凝胶结构,释放出核酸碎片,然后利用核酸碎片直接测量上清溶液中DNA的本征紫外吸收信号,进而实现对目标金属离子浓度的检测;该步骤具体如下:

步骤3a:将80 μL 0~1000 nmol/L不同浓度的Pb2+标准液加入10 μL的DNA水凝胶中,于25 ℃恒温条件下反应;

步骤3b:每隔1 h从PCR管上清中取1~2 μL,用微量核酸蛋白测定仪测试260 nm处吸光度。

2.一种基于纯DNA功能水凝胶的有害金属离子检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤1:设计两条DNA单体序列E2链和S2链,分别包含目标金属离子的DNAzyme和酶切底物,并至少含有三段互补片段;所述目标金属离子为铀酰离子;所述两条DNA单体序列分别为:

S2链:

5’- GAAATGGATGGG TTTTTTT ACTCACTAT/rA/G GA AGAGATGGACGTG TTTTTTTGACAAGAATAAG -3’;

E2链:

5’- CCCATCCATTTC TTTTTTT CACGTCCATCTCT GCAGTCGGGTAGTTAAACC GACCTTCAGACATAGTGAGT TTTTTTT CTTATTCTTGTC -3’;

步骤2:将设计的两条单体序列混合杂交制备纯DNA水凝胶;该步骤具体如下:

步骤2a:将两条单体序列各自按1.5 mM的理论浓度溶解于缓冲液中,并于35 ℃条件下充分溶解;所述缓冲液为含100 mM NaCl的50 mM MES缓冲液,pH为5.5;

步骤2b:采用微量核酸蛋白测定仪中的寡核苷酸分析程序标定真实浓度;

步骤2c:将经过定量的DNA序列,按照E2链与S2链摩尔比1:1,在统一规格的PCR管中,用缓冲液一步混合配制10 μL体积的终浓度为0.3~0.6 mM的DNA水凝胶;

步骤2d:将DNA水凝胶置于PCR仪中,首先升温至60~70 ℃并恒温,用漩涡混合仪将粘稠的DNA水凝胶混匀;

步骤2e:将DNA水凝胶重新置于PCR仪中,升温至65~75 ℃并恒温5 min,然后以0.45℃/min的速率降至10 ℃进行退火;

步骤2f:将制备好的DNA水凝胶置于室温保存;

步骤3:将目标金属离子溶液与制备的纯DNA水凝胶反应30 min~6 h,使DNA水凝胶骨架中特定的DNAzyme被激活并切断底物序列,破坏水凝胶结构,释放出核酸碎片,然后利用核酸碎片直接测量上清溶液中DNA的本征紫外吸收信号,进而实现对目标金属离子浓度的检测;该步骤具体如下:

步骤3a:将80 μL 0~1000 nmol/L不同浓度的铀酰标准液加入10 μL的DNA水凝胶中,于25 ℃恒温条件下反应;

步骤3b:每隔1 h从PCR管上清中取1~2 μL,用微量核酸蛋白测定仪测试260 nm处吸光度。

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