[发明专利]一种呼吸道病原微生物检测用引物及其应用在审
申请号: | 202011090809.X | 申请日: | 2020-10-13 |
公开(公告)号: | CN112176106A | 公开(公告)日: | 2021-01-05 |
发明(设计)人: | 郭静;杨思雨;董思远;舒芹;张雪娇;赵愿安 | 申请(专利权)人: | 华芯生物科技(武汉)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京众达德权知识产权代理有限公司 11570 | 代理人: | 詹守琴 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖开*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 呼吸道 病原微生物 检测 引物 及其 应用 | ||
1.一套呼吸道病原微生物检测用引物,其由以下序列所示的引物组成:
IAV-F:GACAAGACCRATYCTGTCACCTYTGACTAAGGG
IAV-R:ATTGAGGGCATTYTGGACAAAKCGTCTACGCTGC
IBV-F:GACTACCCTGGTCAAGACCGCCTAAACAGACTAA
IBV-R:TGTCATCAAGGCACCTTCCTGGTGTTAGAGGGTAA
2019-nCoV-1F:GGTAATGCAACAGAAGTGCCTGCCAATTCAACTCT
2019-nCoV-1R:AACGATTGTGCATCAGCTGACTGAAGCATGGGTTC
2019-nCoV-2F:GTCGGCCCCAAGGTTTACCCAATAATACTGCGTC
2019-nCoV-2R:TGAGGAAGTTGTAGCACGATTGCAGCATTGTTAGC。
2.根据权利要求1所述的呼吸道病原微生物检测用引物,其特征在于,所述引物用于检测甲型流感病毒、乙型流感病毒和新型冠状病毒。
3.一种呼吸道病原微生物的检测方法,包括使用等温扩增检测呼吸道病原微生物的存在;其特征在于,所述检测方法包括:
提取获得目标微生物DNA/RNA;
使用如权利要求1或2所述的引物对所述目标微生物DNA/RNA进行RPA扩增,得到扩增产物;
检测所述扩增产物。
4.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于,所述RPA扩增体系包括:
25μL的2x反应缓冲液;
0.7μL的摩尔浓度为2.5mM的dNTP;
5.5μL水;
5μL的10x基本酶混合液;
1.2μL的摩尔浓度为10μM的所述引物IAV-F和IAV-R;
1.2μL的摩尔浓度为10μM的所述引物IBV-F和IBV-R;
1.2μL的摩尔浓度为10μM的所述引物2019-nCoV-1F和2019-nCoV-1R;
1.2μL的摩尔浓度为10μM的所述引物2019-nCoV-2F和2019-nCoV-2R;
2.5μL的20x核心反应混合液;
1μL的50x反转录酶;
2.5μL的摩尔浓度为280mM的MgOAc;
3μL的所述目标微生物DNA/RNA。
5.根据权利要求3或4所述的检测方法,其特征在于,使用如权利要求1或2所述的引物对所述目标微生物DNA/RNA进行RPA扩增,包括:
将25μL的2x反应缓冲液、0.7μL的摩尔浓度为2.5mM的dNTP、5.5μL水、5μL的10x基本酶混合液涡旋混合,得到第一预混液;
将所述第一预混液与2.5μL的20x核心反应混合液混合,离心,后添加1μL的50x反转录酶,再次离心,得到第二预混液;
将所述第二预混液与1.2μL的摩尔浓度为10μM的所述引物IAV-F和IAV-R、1.2μL的摩尔浓度为10μM的所述引物IBV-F和IBV-R、1.2μL的摩尔浓度为10μM的所述引物2019-nCoV-1F和2019-nCoV-1R、1.2μL的摩尔浓度为10μM的所述引物2019-nCoV-2F和2019-nCoV-2R涡旋混合,得到第三预混液;
将2.5μL的摩尔浓度为280mM的MgOAc、3μL的所述目标微生物DNA/RNA与所述第三预混液混合,离心,后于温度为42℃下孵育20min。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,所述将2.5μL的摩尔浓度为280mM的MgOAc、3μL的所述目标微生物DNA/RNA与所述第三预混液混合,离心,后于温度为42℃下孵育20min,包括:
将2.5μL的摩尔浓度为280mM的MgOAc、3μL的所述目标微生物DNA/RNA以保持分离的状态添加到试管盖上,经离心后落入包含有所述第三预混液的试管中,再次离心,后于温度为42℃下孵育20min。
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