[发明专利]一种基于JSON的基因本体映射系统及方法

权利要求书

1.一种基于JSON的基因本体映射方法，其特征在于所述方法包括：

（a）解析基因本体数据表示格式（Open Biomedical Ontologies，OBO格式），识别基因本体OBO格式版本(format-version)、对象类标识号(id)、名称(name)、命名空间(namespace)等元数据信息，获取基因本体元数据类别及关系特征，逐层抽取基因本体层次关系、类别特征和元数据-属性值信息，层次关系包含基因本体中的父子关系、部分关系和调控关系三种关系，类别特征包含基因本体中的细胞组分、分子功能、生物过程三个类别，元数据-属性值信息包含基因本体中的tag-value对信息；（b）以基因本体术语(term)对象为划分单元，建立基因本体术语与JSON对象数组之间以及基因本体对象tag-value对与JSON对象key-value对之间的映射关系，采用半监督学习方法抽取上述元数据，（c）将基因本体数据转换存储到JSON文件中，完成从基因本体到JSON的数据迁移。

2.如权利要求1所述的一种基于JSON的基因本体映射方法，其特征在于：使用基于JSON的基因本体映射系统，所述系统包括：（a）数据预处理模块，用于获取加载的原始基因本体数据；（b）数据抽取模块，用于使用半监督学习方法抽取基因本体元数据；（c）数据转换模块，用于通过基因本体与JSON映射模型将上一步抽取获得的基因本体元数据转换成为JSON数据；（d）数据存储模块，用于存储上一步获得的JSON迁移数据；（e）可视化模块，用于提供映射规则筛选和管理、数据统计分析以及上述所有功能模块的可视化操作界面。