[发明专利]一种基于机器学习算法的用于预测CRC转移的影像组学(RA)模型在审
申请号: | 202011093666.8 | 申请日: | 2020-10-14 |
公开(公告)号: | CN112330596A | 公开(公告)日: | 2021-02-05 |
发明(设计)人: | 曾凡新;蔡建强;李雪;吴敏;刘杰;宋俐 | 申请(专利权)人: | 达州市中心医院 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06Q10/04;G06N3/12;G16H50/30;G16H50/70 |
代理公司: | 北京盛凡智荣知识产权代理有限公司 11616 | 代理人: | 李青 |
地址: | 635000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 机器 学习 算法 用于 预测 crc 转移 影像 ra 模型 | ||
1.一种基于机器学习算法的用于预测CRC转移的影像组学(RA)模型,其特征在于,所述模型的计算公式如下:
RA core=7.069e-01+3.723*wavelet_HHH_glszm_LowGrayLevelZoneEmphasis+2.593e-01*original_firstorder_Median-2.759e-01*wavelet_HHH_glszm_GrayLevelNonUniformityNormalized-5.711e-01*original_firstorder_90Percentile-1.971e+00*wavelet_HHH_glszm_SizeZoneNonUniformityNormalized+1.169*wavelet_HHH_glszm_GrayLevelVariance+3.480e-01*original_firstorder_10Percentile-5.645e-03*wavelet_HHH_glszm_SizeZoneNonUniformity+8.628e-01*original_firstorder_InterquartileRange+1.758e-02*wavelet_HHH_glszm_GrayLevelNonUniformity-6.953e-01*wavelet_HHH_glszm_HighGrayLevelZoneEmphasis+1.312e-01*wavelet_HHH_glszm_ZoneEntropy-5.987e+05*diagnostics_Mask_corrected_Maximumoriginal_firstorder_Range+5.987e+05*diagnostics_Mask_corrected_Minimum-9.221e-06*wavelet_LLL_glszm_LargeAreaLowGraylevelEmphasis+3.474e05*wavelet_LLH_glszm_LargeAreaLowGraylevelEmphasis-4.341e+01*wavelet_HHH_ngtdm_Contrast+1.969e-01*wavelet_LLL_firstorder_Skewness;
上述的计算结果RA score>-3.035时,即表示患者的CRC肿瘤转移的风险比较高。
2.根据权利要求1所述的一种基于机器学习算法的用于预测CRC转移的影像组学(RA)模型,其特征在于,上述的影像组学模型包含有19个影像特征。
3.一种基于机器学习算法用于预测CRC转移的影像组学(RA)模型的建立方法,其特征在于,权利要求1或权利要求2的影像组模型的建立的步骤如下:
(1)收集整理CRC患者的信息,建立DZCH 1训练队列和DZCH 2独立验证队列信息数据库;
(2)收集DZCH 1队列的病患的CT扫描图像信息,并对图像进行分割和图像特征提取;收集DZCH 1队列患者的肿瘤组织,并对其进行转录组测序与分析;
(3)采用遗传算法(GAs)筛选出50个影像组及转录组学特征,采用其中的15个Top基因和4个影像组特征来构建能够预测CRC患者转移的影像转录组(RT)模型,并利用DZCH 2独立验证队列来验证影像转录组(RT)模型的性能;
(4)从TCGA数据库中下载CRC患者的转录组数据,利用其验证步骤(2)所建立的RT模型中的基因,筛选出IL26基因作为预测CRC转移的生物标志物;
(5)收集整理CRC患者的信息,建立DZCH 3队列,基于IL26基因生物功能分析,利用DZCH3队列构建IL26与影像组学的生物学联系;然后利用逐步回归分析的方法,筛选出与IL26表达密切相关15个影像组学特征;
(6)将步骤(3)筛选出的4个影像组学特征与步骤(5)筛选出的15个影像组学进行结合,构建包含有19个影像特征的能够对CRC转移进行预测的模型。
4.根据权利要求3所述的一种基于机器学习算法的用于预测CRC转移的影像组学模型的建立方法,其特征在于,其还包括对步骤(6)构建的模型进行验证。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于达州市中心医院,未经达州市中心医院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202011093666.8/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。