[发明专利]利用猪2号染色体基因多态性位点辅助检测猪背膘厚性状的方法、引物、试剂盒及应用

说明书

本发明公开了一种利用猪2号染色体基因多态性位点辅助检测猪背膘厚性状的方法、引物、试剂盒及应用。该方法为：检测待测猪的猪2号染色体自5′末端起第71588075位脱氧核糖核苷酸是G还是A，确定待测猪的基因型是GG还是AA，GG基因型猪背膘厚高于AA基因型猪；使用所述引物对所述试剂盒按所述方法检测待测猪的猪2号染色体自5′末端起第71588075位脱氧核糖核苷酸是G还是A，确定待测猪的基因型是GG还是AA；选择AA基因型的猪进行育种，可获得更薄背膘厚性状的猪。用该方法选择猪的性状，可使猪背膘厚变薄约0.83cm，从而获得生产性能更高的猪。用该方法对猪育种，可缩短选取优良种猪时间，降低育种花费。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，涉及一种利用猪2号染色体(v11.1)自5′末端起第71588075位GA多态性位点辅助检测猪达100kg体重背膘厚性状的方法、引物、专用试剂盒及应用，即一种利用猪2号染色体基因多态性位点辅助检测猪背膘厚性状的方法、引物、试剂盒及应用。

背景技术

猪的达100kg体重背膘厚不仅与瘦肉率有关，与生长速度也存在强相关，因此，其在育种上的价值很高，一直是猪育种目标的重要组成部分。但是，达100kg体重背膘厚的测定时段为猪只体重在85-110kg范围，只能在猪长成之后才能测定。对其成年后测定一方面会加大育种成本，另一方面会拉长世代间隔，减缓遗传进展速度，对其进行早期选择优势明显。分子生物技术、芯片技术、测序技术的飞速发展为猪达100kg体重背膘厚等数量性状开展育种更早、更准确、进展更快速的分子育种提供了研究基础。而且，由于猪的器官大小和人比较相似，是人类研究的一种重要的模式动物，因此，找到猪对达成年体重背膘有影响的基因有可能对人类的肥胖的研究提供一定的借鉴意义。

发明内容

本发明的目的是：克服现有技术的不足，提供一种利用国际猪基因组11.1版本(v11.1)参考序列中的猪2号染色体自5′末端起第71588075位GA多态性位点辅助检测猪达100kg体重背膘厚性状的方法、引物、专用试剂盒及应用，即一种利用猪2号染色体基因多态性位点辅助检测猪背膘厚性状的方法、引物、试剂盒及应用。

本发明的技术方案如下：

本发明提供一种利用猪2号染色体基因多态性位点辅助检测猪背膘厚性状的方法，即一种利用国际猪基因组11.1版本参考序列中的猪2号染色体g.71588075GA多态性位点辅助检测猪达100kg体重背膘厚性状的方法，该方法为：检测待测猪的猪2号染色体(v11.1)自5′末端起第71588075位脱氧核糖核苷酸是G还是A，亦即检测待测猪的国际猪基因组11.1版本参考序列中的猪2号染色体自5′末端起第71588075位脱氧核糖核苷酸是G还是A，确定待测猪的基因型是GG还是AA，GG基因型的猪的背膘厚高于AA基因型的猪的背膘厚；所述GG基因型为国际猪基因组11.1版本参考序列中的猪2号染色体(v11.1)自5′末端起第71588075位脱氧核糖核苷酸为G的纯合体；所述AA基因型为国际猪基因组11.1版本参考序列中的猪2号染色体(v11.1)自5′末端起第71588075位脱氧核糖核苷酸为A的纯合体。

进一步地，所述检测待测猪的猪2号染色体(v11.1)自5′末端起第71588075位脱氧核糖核苷酸是G还是A的方法具体为测序分析。

进一步地，所述测序分析包括PCR扩增和对PCR扩增产物进行测序的步骤；所述PCR扩增所用的引物对满足如下条件:以待测猪的基因组DNA为模板使用该引物对进行PCR扩增得到的扩增产物，含有猪2号染色体(v11.1)自5′末端起第71588075位脱氧核糖核苷酸。

进一步地，所述PCR扩增所用的引物对，是根据国际猪基因组11.1版本参考序列中的猪2号染色体(v11.1)g.71588075GA上下游序列信息，设计并合成的一对引物，具体如下：

U(上游引物)：5’-GAGATGGCTTCACTGAGG-3’(序列表中的序列1)；