[发明专利]一种医学影像分析数据集的封装传输方法有效
申请号: | 202011115478.0 | 申请日: | 2020-10-19 |
公开(公告)号: | CN112350999B | 公开(公告)日: | 2021-08-24 |
发明(设计)人: | 李理;刘巍峰;吴洪波 | 申请(专利权)人: | 北京理工大学 |
主分类号: | H04L29/06 | 分类号: | H04L29/06;H04L29/08 |
代理公司: | 北京正阳理工知识产权代理事务所(普通合伙) 11639 | 代理人: | 王松 |
地址: | 100081 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 医学影像 分析 数据 封装 传输 方法 | ||
1.一种医学影像分析数据集的封装传输方法,其特征在于:所依托系统的用户包括研究中心和研究成员,二者都是研究医学影像分析算法的医学机构,其中,对医学影像分析数据集进行授权共享的发起者称为研究中心,参与者称为研究成员;
其中,研究中心和研究成员,二者都有内网和公网这两个安全级别不同的网络,二者的内网和公网之间都有字节流网闸;
其中,内网即信任网,公网即非信任网;
所述医学影像分析数据集的封装传输方法依托的系统除了包括研究中心以及研究成员;还包括三码授权确认模块、高通量数据传输模块及动态数据封装模块;
三码授权确认模块生成传输标识码集,该传输标识码集包括特征码、授权码以及验证码这三类码;
动态数据封装模块生成医学影像分析数据集,该医学影像分析数据集包含原生影像数据、医学征象描述数据、属性数据以及算法解析数据;
算法解析数据是采用医学影像分析算法对ROI进行解析获取的数据,包括目标检测数据、特征抽取数据以及分类判别数据;
所述系统各模块的连接关系如下:
动态数据封装模块将医学影像分析数据集,输出给研究中心和三码授权确认模块;三码授权确认模块将传输标识码集,输出给研究中心和研究成员;研究中心将医学影像分析数据集,通过高通量数据传输模块,输出给研究成员;
所述封装传输方法,包括如下步骤:
步骤1,研究中心使用动态数据封装模块封装医学影像分析数据集,并将该数据集输出给三码授权确认模块,具体为:
步骤1.1动态数据封装模块将原生影像数据、医学征象描述数据、属性数据、算法解析数据,封装在医学影像分析数据集的全结构化数据结构中;
步骤1.2,调用MongoDB的mongodump/mongorestore命令对全结构化数据结构进行持久化,存储为能够导入导出的.bson格式的二进制文件,即将医学影像分析数据集表达为二进制文件形态;
步骤1.3,将二进制文件形态的医学影像分析数据集输出给研究中心和三码授权确认模块;
步骤2,研究中心和研究成员基于三码授权确认模块生成传输标识码集,确认对医学影像分析数据集进行授权共享;
步骤3,研究中心将医学影像分析数据集,通过高通量数据传输模块,输出给研究成员,具体为:
步骤3.1,研究中心将医学影像分析数据集序列化为字节流,再对字节流进行压缩,将压缩后的字节流进行拆分并通过字节流网闸进行传输,将拆分结果写入字节流文件目录;
步骤3.2,高通量数据传输模块对字节流网闸进行多目录多线程并行扫描,将获取的字节流输出给RabbitMQ;
步骤3.3,研究成员从RabbitMQ获取消息,根据字节流文件目录将拆分的字节流进行重组,解压,反序列化,获得医学影像分析数据集。
2.根据权利要求1所述的一种医学影像分析数据集的封装传输方法,其特征在于:原生影像数据是按DICOM标准分级记录不同病种、不同模态的时空序列影像,包括图像数据和序列数据,DICOM标准即Digital Imaging and Communications in Medicine,医学数字成像和通信标准。
3.根据权利要求1所述的一种医学影像分析数据集的封装传输方法,其特征在于:医学征象描述数据包含采用临床手段获得的对ROI的专家标注数据,临床手段包括微创手术、病理检查,专家标注数据包括微创结果、病理结果。
4.根据权利要求1所述的一种医学影像分析数据集的封装传输方法,其特征在于:属性数据包括数据作者、病例介绍以及算法版本。
5.根据权利要求1所述的一种医学影像分析数据集的封装传输方法,其特征在于:ROI即Region of Interest,其含义为:感兴趣区域。
6.根据权利要求1所述的一种医学影像分析数据集的封装传输方法,其特征在于:步骤1.2中,MongoDB是一种非关系型数据库系统。
7.根据权利要求1所述的一种医学影像分析数据集的封装传输方法,其特征在于:步骤3.2中,RabbitMQ是一种高吞吐量、低延迟的消息队列。
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