[发明专利]与脊尾白虾生长相关的SNP标记、检测引物及应用

说明书

本发明涉及一种与脊尾白虾生长相关的SNP标记、检测引物及应用，属于甲壳动物遗传育种技术领域，所述SNP标记所在的基因序列为SEQ ID No.1，或所述基因序列的5’端第567个位点，其碱基由C突变为T。所述SNP标记M567的CC基因型个体的体长、体重性状显著的大于TT基因型和CT基因型的个体，本发明还提供一种用于检测上述SNP标记M567的引物及利用该引物进行生长快品种的选育，用于选育快速生长的脊尾白虾。

技术领域

本发明属于甲壳动物遗传育种技术领域，具体涉及一种与脊尾白虾生长相关的SNP标记、检测引物及应用。

背景技术

脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)隶属于十足目，长臂虾科，白虾属，主要分布于中国大陆沿岸和朝鲜半岛西岸的浅海低盐水域，以渤海和黄海产量最大。脊尾白虾具有环境适应力强、繁殖周期短、繁殖季节长、抗病力强等特点，目前全国脊尾白虾养殖面积超过40万亩，年产量约5万吨，年产值超过30亿元，已发展成我国海水养殖特色经济虾类之一。随着养殖规模的扩大，目前养殖主要依靠捕捞野生亲虾放入池塘自然繁殖，存在个体间差异大、生长速度缓慢等问题，影响养殖效益。因此，对脊尾白虾生长性状进行遗传改良是促进脊尾白虾养殖业发展的重要举措。

生长性状是水产动物优良品种培育过程中重要的测试指标，也是直接的育种目标。甲壳动物的生长发育主要依赖于蜕皮过程中肌肉的重塑和生长速率。肌肉的生长发育是一个受多种基因和信号分子调控的复杂过程，肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因是哺乳动物肌肉生长发育及分化的重要负调控基因，其基因突变或蛋白功能的缺失会促进肌细胞增殖和肌纤维增大。MSTN基因的多态性与水产动物的生长性状存在显著相关关系，研究表明，中华绒螯蟹MSTN基因第一个外显子的一个SNP位点对其体重和壳长性状具有显著的影响。

分子标记辅助育种(molecular marker-assisted breeding,MAS)是借助与性状紧密相关的分子标记对具有性状优势的等位基因或基因型的个体进行直接选择育种，是分子生物学和基因组学的研究结果应用到水产养殖品种选育的技术。开展DNA水平的标记辅助育种是科学发展的必然，其提高了选择的准确性，降低了育种成本，加快遗传进展。但甲壳动物的分子标记辅助育种尚处于初级阶段，需要筛选获得更多与经济性状相关的重要SNP标记并应用于分子标记辅助育种中。

发明内容

本发明要解决的技术问题在于提供一种脊尾白虾生长相关的SNP标记所在基因、分型引物及应用，即找到对脊尾白虾生长起重要调控作用的MSTN基因上与脊尾白虾体长、体重性状显著相关的SNP标记，并用于选育快速生长的脊尾白虾。

本发明是通过如下技术方案来实现的：

本发明首先提供一种与脊尾白虾生长相关的SNP标记所在基因，所述SNP标记位于MSTN基因的外显子区域，所述基因的基因组序列为SEQ ID No.1，所述基因序列的5’端第567个位点，其碱基为C或T，即为SNP标记M567。

所述SNP标记M567的CC基因型个体的体长、体重性状显著的大于TT基因型和CT基因型的个体(P0.05)，且该位点未改变氨基酸的构成。

本发明还提供一种用于检测上述SNP标记M567的引物，包括正向引物：5'-ATCAGGTTCAATGCTCCACA-3'，反向引物：5'-GAGCCTCTACCACTAAACCAAG-3'。

本发明利用所述引物在脊尾白虾快速生长品种选育中的应用，利用所述引物筛选具有SNP标记M567CC基因型的脊尾白虾育种材料，其具体的操作方法如下：

(1)提取脊尾白虾待检测样品的基因组DNA；

(2)以步骤(1)获得的基因组DNA为模板，利用检测SNP标记M567的引物进行PCR扩增，获得PCR产物；