[发明专利]一种用于鉴别高龄个体的生物种群标志物及其获得方法和应用

权利要求书

1.一种用于鉴别高龄个体的生物种群标志物，其特征在于，所述生物种群标志物包括：

大肠杆菌Escherichia coli、昂氏另枝菌Alistipes onderdonkii、沙氏另枝菌Alistipes shahii、梵氏另枝菌Alistipes finegoldii、另枝菌Alistipes_sp_AP11、粪拟杆菌Bacteroides caccae、内脏臭气杆菌Odoribacter splanchnicus、鱼腥味锥形杆菌Pyramidobacter piscolens、戈氏副拟杆菌Parabacteroides goldsteinii和伪小球菌Subdoligranulum_sp_4_3_54A2FAA；

其中，根据95％置信区间，所述大肠杆菌Escherichia coli的相对丰度区间为6.51×10^-2～1.14×10^-1，所述昂氏另枝菌Alistipes onderdonkii的相对丰度区间为2.54×10^-2～4.81×10^-2，所述沙氏另枝菌Alistipes shahii的相对丰度区间为1.31×10^-2～2.00×10^-2，所述梵氏另枝菌Alistipes finegoldii的相对丰度区间为3.66×10^-3～6.51×10^-3，所述另枝菌Alistipes_sp_AP11的相对丰度区间为3.14×10^-3～5.71×10^-3，所述粪拟杆菌Bacteroides caccae的相对丰度区间为1.53×10^-2～3.37×10^-2，所述内脏臭气杆菌Odoribacter splanchnicus的相对丰度区间为8.75×10^-3～1.46×10^-2，所述鱼腥味锥形杆菌Pyramidobacter piscolens的相对丰度区间为1.06×10^-3～1.04×10^-2，所述戈氏副拟杆菌Parabacteroides goldsteinii的相对丰度区间为2.79×10^-3～7.18×10^-3，所述伪小球菌Subdoligranulum_sp_4_3_54A2FAA的相对丰度区间为2.61×10^-3～7.18×10^-3。

2.一种如权利要求1所述生物种群标志物的获得方法，其特征在于，步骤包括：

S1、确定高龄个体的粪便样本中所述生物种群标志物的各种微生物丰度；

S2、分别将S1中确定的所述生物种群标志物的各种微生物丰度与其在对照组中的丰度进行比较，依据比较结果获得所述生物种群标志物；

其中，所述对照组包括一组所述个体的子女粪便样本和一组与所述个体的子女年龄一致的健康个体粪便样本。

3.根据权利要求2所述的获得方法，其特征在于，所述步骤S1包括：

S1-1、获得个体的粪便样本中核酸序列的测序数据，所述测序数据包括多个读段；

S1-2、确定所述生物种群标志物的各种微生物包含的组装片段；

S1-3、依据所述测序数据，分别确定所述基因集中的各个组装片段的丰度，包括分别确定所述生物种群标志物的各种微生物包含的组装片段的丰度；

S1-4、分别依据所述确定组装片段的丰度，确定所述生物种群标志物的各种微生物的丰度。

4.根据权利要求3所述的获得方法，其特征在于，所述步骤S1-2包括：

将所述基因集中的组装片段分别与所述各种微生物的参考序列进行比对，若与一种微生物参考序列的相似性大于或者等于90％，则所述组装片段来自该种微生物。

5.根据权利要求2所述的获得方法，其特征在于，所述微生物的丰度为该种微生物包含的所有组装片段的丰度的中位数或者平均数。