[发明专利]一种核酸检测试剂盒、检测方法及应用在审
申请号: | 202011138650.4 | 申请日: | 2020-05-19 |
公开(公告)号: | CN112176107A | 公开(公告)日: | 2021-01-05 |
发明(设计)人: | 马培翔;王鑫杰 | 申请(专利权)人: | 上海科技大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12R1/93 |
代理公司: | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人: | 王卫彬;黄益澍 |
地址: | 201210 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 核酸 检测 试剂盒 方法 应用 | ||
1.一种核酸检测试剂盒,其包括Cpf1检测体系,其特征在于,所述Cpf1检测体系包括:向导RNA、Cpf1蛋白、核酸探针和含锰离子的溶液;
所述Cpf1蛋白的氨基酸序列选自:
将如SEQ ID NO: 54所示的T152、G532和K538突变为R后的序列;或将如SEQ ID NO: 54所示的T152和G532突变为R后所示的序列;或将如SEQ ID NO: 55所示的E184、N607和K613突变为R后所示的序列;或将如SEQ ID NO: 55所示的E184和N607突变为R后所示的序列。
2.如权利要求1所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述含锰离子的溶液为硫酸锰、氯化锰或醋酸锰溶液;
所述核酸探针为单链DNA探针;
所述Cpf1蛋白的核苷酸序列如SEQ ID NO. 41、40、35或34所示。
3.如权利要求2所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述单链DNA探针包括荧光标记。
4.如权利要求3所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述单链DNA探针在其5’端和3’端分别具有荧光基团和荧光淬灭基团。
5.如权利要求4所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述单链DNA探针在其5’端具有荧光基团和3’端具有荧光淬灭基团。
6.如权利要求5所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述荧光基团为6-FAM、TET、CY3、CY5或ROX,所述荧光淬灭基团为BHQ1、BHQ2或BHQ3。
7.如权利要求2所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述单链DNA探针的序列为TTTATTT。
8.如权利要求1~7任一项所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述向导RNA为引导Cpf1蛋白特异性结合所述核酸的RNA。
9.如权利要求8所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述向导RNA为crRNA;所述crRNA为检测病毒核酸的crRNA。
10.如权利要求9所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述crRNA为检测SARS相关冠状病毒或MERS-CoV病毒的crRNA。
11.如权利要求10所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述SARS相关冠状病毒为冠状病毒SARS-CoV或SARS-CoV-2。
12.如权利要求9所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述crRNA为检测SARS-CoV病毒orf1ab基因的crRNA、检测MERS-CoV病毒orf1a基因的crRNA、检测MERS-CoV病毒upE基因的crRNA、检测SARS-CoV-2病毒E基因的crRNA、检测SARS-CoV-2病毒S基因的crRNA、检测SARS-CoV-2病毒M基因的crRNA和/或检测SARS-CoV-2病毒N基因的crRNA,所述orf1ab基因的核苷酸序列如SEQ ID NO: 11所示,所述orf1a基因的核苷酸序列如SEQ ID NO: 12所示,所述upE基因的核苷酸序列如SEQ ID NO: 13所示,所述E基因的核苷酸序列如SEQ ID NO: 46所示;所述SARS-CoV-2-S基因的核苷酸序列如SEQ ID NO: 79所示;所述SARS-CoV-2-M基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:80所示;所述SARS-CoV-2-N基因的核苷酸序列如SEQ ID NO: 81所示。
13.如权利要求12所述的核酸检测试剂盒,其特征在于,所述crRNA的核苷酸序列如SEQID NO: 1-10、SEQ ID NO: 47、SEQ ID NO:48和SEQ ID NO: 53、SEQ ID NO: 56-72中的一个或多个所示。
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