[发明专利]一种SSR引物组及其应用在审
申请号: | 202011144623.8 | 申请日: | 2020-10-23 |
公开(公告)号: | CN112080581A | 公开(公告)日: | 2020-12-15 |
发明(设计)人: | 徐德林;邓宽平;陈荣辉;张宏扬;杨丹;周超;史军华 | 申请(专利权)人: | 遵义医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11;G16B40/00 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 瞿晓晶 |
地址: | 563099 贵*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 ssr 引物 及其 应用 | ||
1.一种SSR引物组,其特征在于,所述SSR引物组包括22对SSR引物:Rubus166b、Rubus1b、Rubus105b、Rubus153a、Rubus25a、Rubus223a、Rubus22a、Rubus167a、Rubus253a、Rubus24a、Rubus110a、Rubus260a、ZA005、ZA004、Rubus263f、Rubus279a、Rubus285a、Rubusr56a、Rubus45c、Rubusr35a、Rubusr19a和Rubus243a;所述Rubus166b的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和2所示;所述Rubus1b的引物对的核苷酸序列分别如SEQ IDNO.3和4所示;所述Rubus105b的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.5和6所示;所述Rubus153a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.7和8所示;所述、Rubus25a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.9和10所示;所述Rubus223a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.11和12所示;所述Rubus22a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.13和14所示;所述Rubus167a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.15和16所示;所述Rubus253a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.17和18所示;所述Rubus24a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.19和20所示;所述Rubus110a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ IDNO.21和22所示;所述Rubus260a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.23和24所示;所述ZA005的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.25和26所示;所述ZA004的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.27和28所示;所述Rubus263f的引物对的核苷酸序列分别如SEQID NO.29和30所示;所述Rubus279a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.31和32所示;所述、Rubus285a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.33和34所示;所述Rubusr56a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.35和36所示;所述Rubus45c的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.37和38所示;所述Rubusr35a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ IDNO.39和40所示;所述Rubusr19a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.41和42所示;所述Rubus243a的引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.43和44所示。
2.权利要求1所述SSR引物组在树莓种质资源鉴定中的应用。
3.权利要求1所述SSR引物组在树莓品系鉴别中的应用。
4.权利要求1所述SSR引物组在树莓遗传多样性分析中的应用。
5.权利要求1所述SSR引物组在树莓分子辅助育种中的应用。
6.根据权利要求1~5任一项所述的应用,其特征在于,所述应用包括以下步骤:
1)提取树莓基因组DNA;
2)以步骤1)得到的树莓基因组DNA为模板,分别利用权利要求1所述SSR引物组中的引物对进行PCR扩增,得到扩增产物;
3)将步骤2)得到的扩增产物分别进行电泳分离,根据扩增条带的多态性进行标记和处理、分析。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述电泳包括非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述电泳为利用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分离,150V 90min。
9.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述处理的方法包括:对扩增条带的多态性进行标记后,以扩增条带的出现频率及大小为参考进行人工读带,有带记为“1”,条带不清或缺失记为“0”,以此建立原始(0,1)矩阵。
10.根据权利要求6或9所述的应用,其特征在于,所述分析包括:根据原始(0,1)矩阵的结果,利用NTsys2.10e软件得出样品之间的遗传相似系数和upgma聚类图,进而得出样品之间的遗传关系,实现种质资源鉴定多样性分析和分子育种。
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