[发明专利]结构搜索方法、结构搜索设备和记录介质

权利要求书

1.一种结构搜索方法，包括：

通过计算机在三维晶格空间的多个晶格点中的每个晶格点处顺序地布置n个化合物基团，以在所述三维晶格空间中创建化合物的三维结构，所述n个化合物基团在所述化合物中彼此耦联；以及

通过对基于针对所述晶格点中的每个晶格点的约束条件而变换的伊辛模型执行使用退火方法的基态搜索，来计算所述伊辛模型的最小能量，所述约束条件包括：

所述n个化合物基团中的每个化合物基团被布置仅在一个晶格点处的第一约束；

所述n个化合物基团在所述晶格点中的每个晶格点处彼此不交叠的第二约束；以及

第三约束，其与所述n个化合物基团的耦联相关，并且在不满足所述约束时增加所计算的所述伊辛模型的能量。

2.根据权利要求1所述的结构搜索方法，其中，

所述第三约束是以下约束：

在第一晶格点处存在化合物基团的情况下，在与所述第一晶格点邻近的所有晶格点中的仅一个晶格点处存在化合物基团，以及

在所述第一晶格点处不存在化合物基团的情况下，在与所述第一晶格点邻近的任何晶格点处均不存在化合物基团，或者在与所述第一晶格点邻近的所有晶格点中的仅一个晶格点处存在化合物基团。

3.根据权利要求1所述的结构搜索方法，其中，

所述化合物是蛋白质，以及

所述化合物基团是氨基酸残基。

4.一种非暂态计算机可读记录介质，其中存储有使计算机执行处理的程序，所述处理包括：

在三维晶格空间的多个晶格点中的每个晶格点处顺序地布置n个化合物基团，以在所述三维晶格空间中创建化合物的三维结构，所述n个化合物基团在所述化合物中彼此耦联；以及

通过对基于针对所述晶格点中的每个晶格点的约束条件而变换的伊辛模型执行使用退火方法的基态搜索，来计算所述伊辛模型的最小能量，所述约束条件包括：

所述n个化合物基团中的每个化合物基团被布置在仅一个晶格点处的第一约束；

所述n个化合物基团在所述晶格点中的每个晶格点处彼此不交叠的第二约束；以及

第三约束，其与所述n个化合物基团的耦联相关，并且在不满足所述约束时增加所计算的所述伊辛模型的能量。

5.根据权利要求4所述的非暂态计算机可读记录介质，其中，

所述第三约束是以下约束：

在第一晶格点处存在化合物基团的情况下，在与所述第一晶格点邻近的所有晶格点中的仅一个晶格点处存在化合物基团，以及

在所述第一晶格点处不存在化合物基团的情况下，在与所述第一晶格点邻近的任何晶格点处均不存在化合物基团，或者在与所述第一晶格点邻近的所有晶格点中的仅一个晶格点处存在化合物基团。

6.根据权利要求4所述的非暂态计算机可读记录介质，其中，

所述化合物是蛋白质，以及

所述化合物基团是氨基酸残基。

7.一种结构搜索设备，包括：

在三维晶格空间的多个晶格点中的每个晶格点处顺序地布置n个化合物基团以在所述三维晶格空间中创建化合物的三维结构的单元，所述n个化合物基团在所述化合物中彼此耦联；以及

通过对基于针对所述晶格点中的每个晶格点的约束条件而变换的伊辛模型执行使用退火方法的基态搜索来计算所述伊辛模型的最小能量的单元，所述约束条件包括：

所述n个化合物基团中的每个化合物基团被布置在仅一个晶格点处的第一约束；

所述n个化合物基团在所述晶格点中的每个晶格点处彼此不交叠的第二约束；以及

第三约束，其与所述n个化合物基团的耦联相关，并且在不满足所述约束时增加所计算的所述伊辛模型的能量。