[发明专利]基于颜色判定的逆转录环介导恒温扩增快速检测SARS-COV-2的试剂盒在审
申请号: | 202011212290.8 | 申请日: | 2020-11-03 |
公开(公告)号: | CN112359138A | 公开(公告)日: | 2021-02-12 |
发明(设计)人: | 叶凯;唐光波;李秀娟;窦建华;李子航 | 申请(专利权)人: | 西安交通大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 范巍 |
地址: | 710049 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 颜色 判定 逆转录 环介导 恒温 扩增 快速 检测 sars cov 试剂盒 | ||
1.一种SARS-COV-2逆转录环介导恒温扩增检测引物,其特征在于:该检测引物包括用于特异扩增SARS-COV-2N基因部分片段的RT-LAMP引物和/或用于特意扩增SARS-COV-2orf1ab基因部分片段的RT-LAMP引物;
所述特异扩增SARS-COV-2N基因部分片段的RT-LAMP引物为LAMP-N-F3、LAMP-N-B3、LAMP-N-FIP、LAMP-N-BIP、LAMP-N-LF及LAMP-N-LB,对应引物的序列如SEQ.ID.NO.3、SEQ.ID.NO.4、SEQ.ID.NO.5、SEQ.ID.NO.6、SEQ.ID.NO.7及SEQ.ID.NO.8所示;
所述特异扩增SARS-COV-2orf1ab基因部分片段的RT-LAMP引物为LAMP-orf1ab-F3、LAMP-orf1ab-B3、LAMP-orf1ab-FIP、LAMP-orf1ab-BIP及LAMP-orf1ab-LF,对应引物的序列如SEQ.ID.NO.9、SEQ.ID.NO.10、SEQ.ID.NO.11、SEQ.ID.NO.12及SEQ.ID.NO.13所示。
2.一种SARS-COV-2逆转录环介导恒温扩增检测试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括用于通过改变扩增反应体系颜色从而显示SARS-COV-2核酸阳性扩增结果的pH指示剂,以及用于特异扩增SARS-COV-2N基因部分片段的RT-LAMP引物和/或用于特异扩增SARS-COV-2orf1ab基因部分片段的RT-LAMP引物。
3.根据权利要求2所述一种SARS-COV-2逆转录环介导恒温扩增检测试剂盒,其特征在于:所述特异扩增SARS-COV-2N基因部分片段的RT-LAMP引物为LAMP-N-F3、LAMP-N-B3、LAMP-N-FIP、LAMP-N-BIP、LAMP-N-LF及LAMP-N-LB,对应引物的序列如SEQ.ID.NO.3、SEQ.ID.NO.4、SEQ.ID.NO.5、SEQ.ID.NO.6、SEQ.ID.NO.7及SEQ.ID.NO.8所示;
所述特异扩增SARS-COV-2orf1ab基因部分片段的RT-LAMP引物为LAMP-orf1ab-F3、LAMP-orf1ab-B3、LAMP-orf1ab-FIP、LAMP-orf1ab-BIP及LAMP-orf1ab-LF,对应引物的序列如SEQ.ID.NO.9、SEQ.ID.NO.10、SEQ.ID.NO.11、SEQ.ID.NO.12及SEQ.ID.NO.13所示。
4.根据权利要求2所述一种SARS-COV-2逆转录环介导恒温扩增检测试剂盒,其特征在于:所述pH指示剂包括2mM-5mM的甲酚红和0.5mM-1.25mM的苯酚红。
5.根据权利要求2所述一种SARS-COV-2逆转录环介导恒温扩增检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括扩增反应体系缓冲液,所述缓冲液包括200mM Tris、500mM KCl、100mM(NH4)2SO4、40mM-100mM MgSO4及1%Tween-20。
6.根据权利要求2所述一种SARS-COV-2逆转录环介导恒温扩增检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括Bst DNA聚合酶、高温逆转录酶及dNTP。
7.一种SARS-COV-2逆转录环介导恒温扩增检测方法,其特征在于:该检测方法包括以下步骤:
1)提取样本的RNA;
2)以提取的RNA为模板,并利用用于特异扩增SARS-COV-2N基因、orf1ab基因中某一个基因的部分片段的RT-LAMP引物,建立SARS-COV-2逆转录环介导恒温扩增反应体系,该扩增反应体系还含有pH指示剂,pH指示剂包括2mM-5mM的甲酚红和0.5mM-1.25mM的苯酚红;
3)使所述扩增反应体系进行逆转录环介导恒温扩增反应,然后根据该扩增反应体系的颜色变化对SARS-COV-2的N基因或orf1ab基因对应片段的扩增结果进行判定。
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