[发明专利]一种检测山羊环状RNA中分子标记的方法及其应用

说明书

本发明提供了一种检测山羊环状RNA中分子标记的方法及其应用，所述分子标记位于山羊环状RNA circ_ZCCHC24的DNA序列中，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，该序列长度为2045bp，在该序列中第651bp处存在一处GA碱基突变(命名为g.651GA)、在第1082bp处存在一处GT碱基突变(命名为g.1082GT)、在第1310bp处存在一处AG碱基突变(命名为g.1310AG)。本发明还提供了检测山羊环状RNA中与产羔数或/和生长性状关联的分子标记的检测试剂盒，包括：如SEQ ID NO.4～7所示的引物对；如SEQ ID NO.8～10所示的SNaPshot单碱基延伸引物。本发明发掘了新的分子标记，同时与山羊产羔数或/和生长性状相关联，实现了对山羊产羔数或/和生长性状进行早期选择，检测方法快速、准确，且不受养殖环境条件因素影响。

技术领域

本发明涉及山羊标记辅助选择技术领域，涉及一种检测山羊环状RNA中分子标记的方法及其应用。

背景技术

我国山羊饲养历史悠久，是常见的居民肉食来源。近年来，全球山羊养殖规模不断扩大，尤其中国更是山羊养殖大国。随着消费者对于健康饮食要求的不断增长，由于羊肉具有健康、安全的营养特性，促使其在肉类消费中的比重不断上升。包括体重体尺在内的生长性状是山羊生产中最为重要的经济性状。因此，研究如何通过选育提高山羊的生长性状对于山羊产业和山羊育种研究来说都具有十分重要的意义。

单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)指的是由个体间基因组中同一位置单个核苷酸(A、T、C和G)发生变异所引起的DNA序列的多态性，主要包括碱基的转换、颠换、插入或缺失等四种形式。SNP具有数量多、分布广、杂合率低、遗传稳定性好、适用于高通量自动化检测等特点。因此，SNP可作为分子育种、基因定位、群体进化等研究的首选工具。分子标记辅助选择(Marker-assisted selection，MAS)利用与特定性状相关联的分子标记作为辅助手段进行选择育种。具有快速、准确、不受环境影响的优点，从而加快育种速度，尤其对于低遗传力性状和难以测量的性状具有更大的优势。随着应用基因组学、分子生物学和分子遗传学理论技术的不断发展，MAS技术能有效的加快山羊重要经济性状的选择进展，可对我国山羊产业的可持续发展将带来巨大的经济效益。

环状RNA(Circular RNA,circRNA)是一类新型的内源性非编码RNA，它是在mRNA前体剪切过程中，外显子和(或)内含子的5’端与3’端以反向剪切形式连接，形成的共价闭合环状结构。CircRNA广泛存在于真核细胞内，具有物种保守性、组织特异性和稳定性等特点。CircRNA调控卵泡发育的研究较为有限。Capel等人研究发现小鼠精子决定基因SRY可编码circRNA；在孕产妇衰老过程中，人类卵巢颗粒细胞中circRNA可能在葡萄糖代谢、有丝分裂细胞周期和卵巢激素生成等过程中发挥作用；CircRNA-9119可通过miRNA介导的信号通路参与山羊子宫内膜上皮细胞中PTGS2基因的表达调控。迄今为止，尚无有关山羊环状RNAcirc_ZCCHC24作为产羔数、生长性状的分子标记的研究报道。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术之缺陷，提供了一种检测山羊环状RNA中分子标记的方法及其应用，本发明发掘了三种与山羊产羔数或/和生长性状关联的分子标记，它们同时与山羊产羔数或/和生长性状相关联，为山羊产羔数、生长性状的分子标记辅助育种提供了新的分子标记。

本发明的目的之一在于提供三种与山羊产羔数或/和生长性状关联的分子标记，所述的分子标记位于山羊环状RNA circ_ZCCHC24的DNA序列中，所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，该序列长度为2045bp，所述三种分子标记包括：在该序列中第651bp处存在一处GA碱基突变(命名为g.651GA)、在第1082bp处存在一处GT碱基突变(命名为g.1082GT)、在第1310bp处存在一处AG碱基突变(命名为g.1310AG)。