[发明专利]一种FOLFOX药物方案有效性检测方法及试剂盒在审
申请号: | 202011232493.3 | 申请日: | 2020-11-06 |
公开(公告)号: | CN112195247A | 公开(公告)日: | 2021-01-08 |
发明(设计)人: | 郑晖;谢剑邦;朱燕萍 | 申请(专利权)人: | 南京普恩瑞生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16B5/00;G16B20/20 |
代理公司: | 北京市兰台律师事务所 11354 | 代理人: | 张峰 |
地址: | 210000 江苏省南京市江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 folfox 药物 方案 有效性 检测 方法 试剂盒 | ||
本发明公开了一种FOLFOX药物方案有效性检测方法及试剂盒,步骤如下:步骤1:准备FOLFOX药物方案的药效样品;步骤2:对步骤1的药效样品进行DNA分子标记;步骤3建立多元线性回归数学模型;步骤4:计算FOLFOX药物方案药效有效变量的相关系数;步骤5:根据药效有效变量的相关系数确定FOLFOX药物方案有效性。本发明提供的FOLFOX药物方案有效性检测方法及试剂盒,通过DNA分子标记的方式,从基因层面上研究化疗用FOLFOX药物方案的药效,使化药物方案的药效程度与基因的表现相关联,从而可以更好的判决FOLFOX药物方案药效的有效性,以及预测或辅助预测化疗FOLFOX方案药效的风险。
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种肿瘤治疗过程中FOLFOX药物方案有效性检测方法及试剂盒。
背景技术
肿瘤治疗中化疗用FOLFOX药物方案是抗嘧啶类代谢药,是胃肠道肿瘤的一线化疗药物,主要作用于细胞周期的S期,在体内转化成氟尿嘧啶核苷酸,抑制DNA,RNA的合成,口服吸收不完全,静脉注半小时可进入血脑屏障,主要经肝脏代谢。常用于消化系统肿瘤,如胃癌,结直肠癌,原发性肝癌,胰腺癌,食管癌均较常用。对乳腺癌,卵巢癌,子宫颈癌,癌性胸腹腔积液也有一定疗效。
化疗是广谱性细胞毒药物,参与化疗FOLFOX方案代谢的各种细胞因子、酶等非常复杂,因而每个患者个体对药物的响应均有所不同,个体差异很大。参与FOLFOX药物方案代谢的各种因子均离不开基因的调控,因此不同的基因型可以影响正常组织对药物的敏感性,因此在基因水平上研究化疗用FOLFOX药物方案的药效可以更本质的解决FOLFOX方案药敏预测的问题。
DNA分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是直接在DNA分子上检测生物间的差异,是DNA水平变异的直接反应,DNA分子标记不受环境基因表达与否的限制,数量极多,遍及整个基因组,多态性高,遗传稳定,但是由于DNA分子标记数量过大,很难筛选出与研究目的相关的DNA分子标记。
因此,一种筛选与化疗FOLFOX方案药效相关的DNA分子标记方法,使化疗FOLFOX方案药效的程度与基因水平的表现相关联,是目前有待解决的问题。
发明内容
本发明解决的技术问题:针对上述不足,克服现有技术的缺陷,本发明的目的是提供肿瘤治疗过程中FOLFOX药物方案有效性检测方法及试剂盒。
本发明的技术方案:
一种FOLFOX药物方案有效性检测方法,步骤如下:
步骤1:准备FOLFOX药物方案的药效样品;
步骤2:对步骤1的药效样品进行DNA分子标记,记录分子标记位点的信息;
步骤3:将DNA分子标记位点信息作为自变量,将FOLFOX药物方案的药效信息作为因变量,建立多元线性回归数学模型;
步骤4:根据多元线性回归数学模型,计算FOLFOX药物方案药效的有效变量的相关系数;
步骤5:步骤4获得有效变量的相关系数即为FOLFOX药物方案药效相关的DNA分子标记的权重系数,根据权重系数确定FOLFOX药物方案有效性。
本发明的一个具体实施方式,将样本在筛选出的27个位点的基因型与人类参考基因组版本37号(GRCh37)做比对,当该位点比对的结果为两个拷贝都一致时,该位点的原始赋值为0;当该位点比对的结果为一个拷贝一致时,该位点的原始赋值为1;当该位点比对的结果为两个拷贝均变异型时,该位点的原始赋值为2。然后将每个位点的原始赋值与该位点的权重系数相乘,所得数值为该位点的计算分值。将一个样本的27个位点的计算分值相加,得到的总和即为该样本对应的有效性评判数值。当总和数值大于0.5时,判定为该患者使用化疗FOLFOX方案后会有效。
其中,步骤2中标记物及位点信息如下:
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