[发明专利]一种依据植物双亲基因型信息虚拟合成杂种基因型的方法及应用

权利要求书

1.一种依据植物双亲基因型信息虚拟合成杂种基因型的方法，其特征是，对原始基因组数据进行质量控制、去劣补遗、然后将基因组数据中的碱基符号转变为代表显性的A和隐性的a，再将原始的二倍体形式基因型转变为四倍体形式的基因型，然后将其数值化处理，最后用父、母亲本数值化的四倍体形式的基因型虚拟合成杂交种的二倍体基因型；所获得的数值化的杂交种二倍体基因型数据可直接代入全基因组预测模型，用来预测自交系的特殊配合力和杂交组合的性状表型。

2.如权利要求1所述的一种依据植物双亲基因型信息虚拟合成杂种基因型的方法，其特征是，包括以下步骤：

(1)将来自父、母亲本的基因型数据，进行质量控制，去除杂合率、最小等位基因频率不符合实际情况的材料和SNP标记，去掉缺失率高的分子标记；

(2)补充遗缺数据；

(3)计算每个碱基座的等位碱基频率；

(4)根据等位碱基频率将碱基替换为A/a形式；

(5)将步骤4得到的A/a形式的基因型分别归入父、母本材料列表；

(6)从父、母本材料基因型列表中抽取基因型，合成四碱基A/a形式的杂交种基因型；

(7)根据A和a的频率将A/a转换成数值；

(8)虚拟合成数值化的二倍体杂交种基因型；

(9)将虚拟合成数值化的二倍体杂交种基因型数据直接代入全基因组预测模型预测自交系特殊配合力或杂交组合的表现型。