[发明专利]基于16S微生物扩增测序数据的分析方法、装置及设备

权利要求书

1.一种基于16S微生物扩增测序数据的分析方法，包括：

获取对16S微生物进行测序得到的原始序列数据，对所述原始序列数据进行过滤得到有效序列数据；

确定所述有效序列数据中正向序列和反向序列的质量值；

根据所述质量值对所述正向序列和反向序列进行过滤，得到过滤后的正向序列和反向序列；

将所述正向序列和所述反向序列进行匹配合并，输出合并得到的OTUs序列；

将所述OTUs序列与微生物数据库进行比对注释，确定所述OTUs序列对应的物种注释和丰度信息；

根据所述OTUs序列对应的物种注释和丰度信息进行聚类分组，得到多个组；

基于得到的多个组进行组间差异分析。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对原始序列数据进行过滤得到有效序列数据包括：

去除所述原始序列数据中包含的Barcode序列和PCR引物扩增序列，得到目标序列数据；

根据目标序列数据的质量值进行过滤，得到有效序列数据。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述质量值对所述正向序列和反向序列进行过滤，得到过滤后的正向序列和反向序列，包括：

对所述正向序列和所述反向序列进行质量检测；

当所述正向序列或反向序列中的一个或多个片段的质量不符合要求时，则对质量不符合要求的片段进行剪切过滤，得到剪切过滤后的正向序列和反向序列。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述对所述正向序列和所述反向序列进行质量检测，包括：

采用质量评估模型对过滤后的正向序列和反向序列进行质量检测，得到质检结果。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述将所述正向序列和所述反向序列进行匹配合并，输出合并得到的OTUs序列，包括：

计算所述正向序列和所述反向序列的重叠度，当所述正向序列和所述反向序列的重叠度符合预设要求时，根据对应的重叠区域将所述正向序列和所述反向序列进行合并输出得到OTUs序列。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于得到的多个组进行组间差异分析，包括：

根据每个组对应的物种注释和丰度信息确定不同组间的丰度差异显著的物种；

基于组间的所述丰度差异显著的物种进行差异分析。

7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：

基于得到的多个组进行多样性分析，所述多样性分析包括：Alpha多样性分析和Beta多样性分析。

8.一种基于16S微生物扩增测序数据的分析装置，其特征在于，包括：

第一过滤模块，用于获取对16S微生物进行测序得到的原始序列数据，对所述原始序列数据进行过滤得到有效序列数据；

质量确定模块，用于确定所述有效序列数据中正向序列和反向序列的质量值；

第二过滤模块，用于根据所述质量值对所述正向序列和反向序列进行过滤，得到过滤后的正向序列和反向序列；

合并模块，用于将所述正向序列和所述反向序列进行匹配合并，输出合并得到的OTUs序列；

比对模块，用于将所述OTUs序列与微生物数据库进行比对注释，确定所述OTUs序列对应的物种注释和丰度信息；

聚类模块，用于根据所述OTUs序列对应的物种注释和丰度信息进行聚类分组，得到多个组；

分析模块，用于基于得到的多个组进行组间的差异分析。

9.一种计算机可读存储介质，存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时，使得所述处理器执行如权利要求1至7中任一项所述的基于16S微生物扩增测序数据的分析方法的步骤。

10.一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，所述计算机程序被所述处理器执行时，使得所述处理器执行如权利要求1至7中任一项所述的基于16S微生物扩增测序数据的分析方法的步骤。