[发明专利]一种靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列及其筛选方法在审
申请号: | 202011253224.5 | 申请日: | 2020-11-11 |
公开(公告)号: | CN112342214A | 公开(公告)日: | 2021-02-09 |
发明(设计)人: | 张世勇;陈校辉;王明华;钟立强;段永强;徐思琪;边文冀 | 申请(专利权)人: | 江苏省淡水水产研究所 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/70 |
代理公司: | 南京瑞弘专利商标事务所(普通合伙) 32249 | 代理人: | 徐激波 |
地址: | 210017 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 靶向 斑点 叉尾鮰 zbtb38 基因 sgrna 序列 及其 筛选 方法 | ||
1.一种靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列的筛选方法,其特征在于:包括,
设计CRISPR序列,所述CRISPR序列如序列SEQ NO.1~SEQ NO.8所示;
用所述CRISPR序列制备含目标基因片段的PCR扩增产物,所述目标基因片段如序列SEQNO.9所示;
将所述含目标基因片段的PCR扩增产物与载体连接、转化后筛选阳性转化子,经克隆摇菌并抽提出包含目的基因的质粒;
根据设计的CRISPR序列,用体外转录方法制备sgRNA;
将所述sgRNA、所述包含目的基因的质粒和Cas9蛋白显微注射斑马鱼受精卵,以斑马鱼受精卵作为反应器筛选编辑斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列。
2.如权利要求1所述的靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列的筛选方法,其特征在于:所述CRISPR序列位于zbtb38基因外显子393bp之前。
3.如权利要求1或2项所述的靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列的筛选方法,其特征在于:所述sgRNA,其序列包括序列SEQ NO.21~SEQ NO.28中所示的一种或几种。
4.如权利要求1所述的靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列的筛选方法,其特征在于:所述用体外转录方法制备sgRNA,其使用的正向引物序列包括序列SEQ NO.12~SEQNO.19所示中的一种或几种。
5.如权利要求1-2、4任一项所述的靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列的筛选方法,其特征在于:所述经克隆摇菌并抽提出包含目的基因的质粒,其使用的引物序列包括如序列SEQ NO.10、SEQ NO.11中所示的一种或几种。
6.如权利要求5所述的靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列的筛选方法,其特征在于:所述经克隆摇菌并抽提出包含目的基因的质粒,其使用的载体为pGEM-T Easy载体。
7.如权利要求1所述的靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的sgRNA序列的筛选方法,其特征在于:所述显微注射,其使用的所述sgRNA在注射液中的终浓度为100ng/μL,Cas9蛋白的终浓度为250ng/μL。
8.用于靶向敲除斑点叉尾鮰zbtb38基因的序列,其特征在于:包括,
CRISPR序列,如序列SEQ NO.7所示;
引物,包括序列SEQ NO.10~SEQ NO.20中所示的一种或几种;以及,
sgRNA序列,包括序列SEQ NO.21~SEQ NO.28中所示的一种或几种。
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