[发明专利]肺癌细胞辐射适应性MicroRNA表达谱检测方法在审
申请号: | 202011273225.6 | 申请日: | 2020-11-13 |
公开(公告)号: | CN112195249A | 公开(公告)日: | 2021-01-08 |
发明(设计)人: | 余小玲;荣利;张永明;田丽丽;王小春;张铁军;方芳;丁晓文;谢婷婷;牛东升;李珏 | 申请(专利权)人: | 北京市化工职业病防治院(北京市职业病防治研究院) |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6809 |
代理公司: | 北京绘聚高科知识产权代理事务所(普通合伙) 11832 | 代理人: | 罗硕 |
地址: | 100000 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺癌 细胞 辐射 适应性 microrna 表达 检测 方法 | ||
1.一种肺癌细胞辐射适应性MicroRNA表达谱检测方法,其特征在于,包括:
步骤100.标本选择
将目标肺癌细胞分为实验组和对照组;
其中,实验组:依次采用低剂量、高剂量的射线辐照目标肺癌细胞至细胞消化;
对照组:采用高剂量的射线辐照目标肺癌细胞至细胞消化;
将上述细胞消化后的实验组和对照组进行低温保存;
步骤200.总RNA提取
加入RNA提取试剂至实验组和对照组中的目标肺癌细胞系中,使目标肺癌细胞裂解,对细胞裂解液进行处理后得到水溶解沉淀物;
步骤300.miRNA芯片处理
分别取一定量的实验组和对照组的总RNA,进行芯片杂交,杂交后的芯片进行图像扫描及数据处理,得出不同剂量辐照后的肺癌细胞MicroRNA表达谱的差异数据。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤100中,将目标肺癌细胞分为实验组和对照组之前,包括:
选择目标肺癌细胞系,采用10%FBS,1%青链霉素的培养基,37℃,5%CO2的培养条件下培养至少48小时,使目标肺癌细胞至对数生长期。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤100包括:
对于实验组的目标肺癌细胞:
采用X射线分别按照50mGy、200mGy的辐照剂量照射目标肺癌细胞;
停止照射并至少间隔4小时后,采用20Gy的辐照剂量再次照射目标肺癌细胞至细胞消化后低温保存;
对于对照组的目标肺癌细胞:
采用20Gy的辐照剂量照射目标肺癌细胞至细胞消化后低温保存。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤200包括如下操作步骤:
步骤201:在实验组和对照组中的目标肺癌细胞中,分别加入RNA提取试剂,使目标肺癌细胞裂解,分别收集相对应的细胞裂解液至实验组和对照组的离心管中;
步骤202:在离心管中分别加入氯仿,振荡,离心;
步骤203:吸取上清,加入异丙醇并混匀;
步骤204:将离心管置于冰箱冷藏;
步骤205:取出离心管离心,弃去上清,在管底形成有白色沉淀,加入75%乙醇并振荡,离心;
步骤206:弃去上清,室温下晾干后,加入经DEPC处理的水溶解沉淀。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤300包括:
步骤301:以辐照条件为50mGy-20Gy、200mGy-20Gy的目标肺癌细胞为实验组,以辐照条件20Gy的目标肺癌细胞为对照组,分别取一定量的总RNA,采用微流体芯片进行芯片杂交,杂交后的芯片用微阵列基因芯片扫描仪进行图像扫描,采用生物芯片扫描分析软件进行数据分析,计算两种荧光信号的比值,用t-test进行差异显著性分析,p0.05为有显著性差异;
其中,采用聚类分析方法分析不同剂量辐照后肺癌细胞MicroRNA表达谱的差异;
步骤302:筛选出辐照条件为50mGy-20Gy和200mGy-20Gy的实验组与辐照条件为20Gy的对照组相比较,得出表达有共同显著差异趋势的microRNA的差异数据。
6.根据权利要求1-5任一项所述的方法,其特征在于,还包括:
步骤400.采用qRT-PCR实验方法对表达有共同显著差异趋势的microRNA进行验证。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述步骤400还包括:检测经步骤100处理后的实验组和对照组中,目标肺癌细胞的DNA损伤情况。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述步骤400还包括:检测经步骤100处理后的实验组和对照组中,目标肺癌细胞的凋亡情况。
9.根据权利要求1-4任一项所述的方法,其特征在于,在步骤300之前,还包括:
步骤220.总RNA样本质量检测:
步骤221:琼脂糖凝胶电泳分别分析实验组和对照组的RNA降解程度以及污染程度;
步骤222:采用超微量分光光度计分别检测实验组和对照组的RNA的纯度;
步骤223:采用荧光计分别对实验组和对照组的RNA浓度进行定量;
步骤224:采用生物分析仪分别检测实验组和对照组的RNA的完整性。
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