[发明专利]一种评估他克莫司药物代谢的引物组、试剂盒及评估方法有效
申请号: | 202011278056.5 | 申请日: | 2020-11-16 |
公开(公告)号: | CN112322723B | 公开(公告)日: | 2023-06-13 |
发明(设计)人: | 王子杰;郑明;顾民;谭若芸;居小兵;韩志坚;陶俊;鲁佩;陈浩;孙黎;费爽;王增军 | 申请(专利权)人: | 江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院) |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 江苏瑞途律师事务所 32346 | 代理人: | 金龙;刘琦 |
地址: | 210029 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 评估 司药 代谢 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种评估他克莫司药物代谢的引物组,其特征在于:包含引物对1、引物对2、引物对3、引物对4及引物对5,
所述引物对1的序列为:F: 5’-ATTAGACACGCAAGGACTTCTTCA-3’;R: 5’-TCAAGAAAGCTGTGCCCCAG-3’;
所述引物对2的序列为:F: 5’-TCGAAAGAAACTGAGTCCCACAA-3’;R: 5’-TGCTATGTGGCAAAAATTCTCATC-3’;
所述引物对3的序列为:F: 5’-TCGGAGCCCTCGGAGC-3’;R: 5’-AGGCACATCCTGGCCATC-3’;
所述引物对4的序列为:F: 5’-CGGTCCTGTCCCTGTTTCTG-3’;R: 5’-ACCGTAGGTGGCCATGCA-3’;
所述引物对5的序列为:F: 5’-ACAGGTCCACCCCAACTCTG-3’;R: 5’-ACCCTTCATAGGCTTCATCCAG-3’。
2.一种评估他克莫司药物代谢的试剂盒,其特征在于:包括总RNA提取试剂、PCR扩增试剂以及测序试剂,所述PCR扩增试剂包括权利要求1所述的引物组。
3.一种非诊疗目的的他克莫司药物代谢相关基因型的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)总RNA提取:取受试者的全血标本,进行总RNA提取;
2)PCR扩增:取上述步骤1)提取的总RNA,加入PCR扩增试剂进行PCR扩增得到扩增片段;
3)测序:取步骤2)中扩增得到的片段进行测序,测序结果进行分析,确认该受试者中他克莫司药物代谢相关基因型;所述他克莫司药物代谢相关基因型包括CYP3A5 rs15524、CYP3A5 rs4646453、POR rs2286822、POR rs1135612及POR rs1057868 五个位点的基因型;
所述步骤2)中所采用的PCR扩增试剂包括权利要求1所述的引物组。
4. 根据权利要求3所述的一种非诊疗目的的他克莫司药物代谢相关基因型的检测方法,其特征在于:PCR扩增反应体系为:第一链cDNA 2μL;上游引物2μL;下游引物2μL;dNTP 4μL;10×PCR buffer 5μL;Taq 酶1μL,用双蒸水补足总体积达50μL。
5.根据权利要求3或4所述的一种非诊疗目的的他克莫司药物代谢相关基因型的检测方法,其特征在于:在PCR扩增过程中加入内参特异性引物。
6.根据权利要求5所述的一种非诊疗目的的他克莫司药物代谢相关基因型的检测方法,其特征在于:所述测序结果分析通过htSNPer1.0软件进行。
7.一种非诊疗目的的评估他克莫司药物代谢状态的方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)确定受试者的基因型:通过权利要求6所述的检测方法确认CYP3A5 rs15524、CYP3A5rs4646453、POR rs2286822、POR rs1135612及POR rs1057868五个位点的基因型;
2)根据测定的基因型计算他克莫司血药浓度/单位体重剂量比,计算公式如下:
他克莫司血药浓度/单位体重剂量比Y=41.474+7.437×性别+0.286×年龄+9.879×肾功能延迟恢复-8.554×rs15524基因型+8.878×rs4646453基因型-23.462×rs1135612基因型+26.243×rs2286822基因型-1.167×rs1057868基因型+0.059×移植后时间,
公式中各参数赋值如下:
所述年龄用岁来计算,所述移植后时间用天来计算;
性别:当受试者为女性时,性别=0,当受试者为男性时,性别=1;
肾功能延迟恢复:当受试者未发生肾功能延迟恢复时,肾功能延迟恢复=0;当受试者发生肾功能延迟恢复时,肾功能延迟恢复=1;
rs15524基因型:当受试者的rs15524基因型为TT时,rs15524基因型=0;当受试者的rs15524基因型为TC时,rs15524基因型=1;当受试者的rs15524基因型为CC时,rs15524基因型=2;
rs4646453基因型:当受试者的rs4646453基因型为TT时,rs4646453基因型=0;当受试者的rs4646453基因型为TC时,rs4646453基因型=1;当受试者的rs4646453基因型为CC时,rs4646453基因型=2;
rs1135612基因型:当受试者的rs1135612基因型为CC时,rs1135612基因型=0;当受试者的rs1135612基因型为CT时,rs1135612基因型=1;当受试者的rs1135612基因型为TT时,rs1135612基因型=2;
rs2286822基因型:当受试者的rs2286822基因型为AA时,rs2286822基因型=0;当受试者的rs2286822基因型为AG时,rs2286822基因型=1;当受试者的rs2286822基因型为GG时,rs2286822基因型=2;
rs1057868基因型:当受试者的rs1057868基因型为CC时,rs1057868基因型=0;当受试者的rs1057868基因型为CT时,rs1057868基因型=1;当受试者的rs1057868基因型为TT时,rs1057868基因型=2。
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