[发明专利]一种评价蛋白组学质谱数据质量的方法

权利要求书

1.一种评价蛋白组学质谱数据质量的方法，其特征在于，质谱数据质量的鉴定结果的决定因素包括二级谱采集数、二级谱利用率和二级谱质量，所述方法包括：

通过对测试得到的质谱数据进行打分，以获得一级打分结果，所述一级打分结果包括鉴定结果得分、二级谱采集数得分、二级谱利用率得分和二级谱质量得分；

再以所述鉴定结果得分、所述二级谱采集数得分、所述二级谱利用率得分和所述二级谱质量得分的平均分作为质谱数据质量评价总分。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，每个所述一级打分结果均通过二级打分结果计算得到，对于质谱数据的每项二级打分，根据线性打分标准，在预设值区间内的实际值被赋予分数，超出预设值区间取最高分和最低分；

优选地，所述鉴定结果得分对应的二级打分结果包括肽段鉴定结果得分和蛋白组鉴定结果得分；

优选地，所述二级谱采集数得分对应的二级打分结果包括平均二级谱采集速度得分、二级谱采集总数与一级谱采集总数的比值得分、最大二级谱采集速度得分和色谱死体积决定的谱图有效采集时间得分中的至少一种；

优选地，所述二级谱利用率得分对应的二级谱打分结果包括二级谱数和肽段数的比值的得分、肽段洗脱全长时间中值得分和色谱拖尾情况得分中的至少一种；

优选地，所述二级谱质量得分对应的二级谱打分结果包括鉴定率得分、评价相对质量偏差得分、相对质量偏差的标准差得分、酶切特异性得分、漏切情况得分和半胱氨酸修饰情况得分中的至少一种。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述鉴定结果得分为肽段鉴定结果得分和蛋白组鉴定结果得分的平均值；

所述肽段鉴定结果得分的二级打分规则为：当每小时鉴定肽段的序列数小于或等于10000时，取最低分，当每小时鉴定肽段的序列数大于或等于35000时，取最高分，当每小时鉴定肽段的序列数大于10000且小于35000时，按照线性打分标准计算；

所述蛋白组鉴定结果得到的二级打分规则为：当每小时鉴定蛋白组数量小于或等于1500时，取最低分，当每小时鉴定蛋白组数量大于或等于3000时，取最高分，当每小时鉴定蛋白组数量大于1500且小于3000时，按照线性打分标准计算。

4.根据权利要求2或3所述的方法，其特征在于，所述二级谱采集数得分为二级谱平均采集速度得分，所述二级谱平均采集速度得分的二级打分规则为：当二级谱平均采集速度小于或等于3Hz时，取最低分，当二级谱平均采集速度大于或等于40Hz，取最高分，当二级谱平均采集速度大于3Hz且小于40Hz时，按照线性打分标准计算。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述二级谱利用率得分为二级谱数和肽段数的比值的得分，二级谱数和肽段数的比值的得分的二级打分规则为：当二级谱数和肽段数的比值小于或等于1.2时，取最高分，当二级谱数和肽段数的比值大于或等于2时，取最低分，当二级谱数和肽段数的比值大于1.2且小于2时，按照线性打分标准计算。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述二级谱质量得分为鉴定率得分，所述鉴定率得分的二级打分规则为：当识别率小于或等于20％时，取最低分，当识别率大于或等于85％时，取最高分，当识别率大于20％且小于85％时，按照线性打分标准计算。

7.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述最低分设置为0.5～1分，所述最高分设置为5～10分，优选地，最低分设置为1分，最高分设置为5分。

8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述质谱数据包括质谱实验中所有采集的谱图和鉴定的肽段的数据。

9.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，将所述质谱数据质量评价总分和多个所述一级打分结果进行可视化，并输出数据可视化结果。

10.一种可存储介质，其特征在于，所述可存储介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时，执行如权利要求1～9任一项所述的评价蛋白组学质谱数据质量的方法。