[发明专利]分子动力学力场参数拟合工作流控制系统及其控制方法在审
申请号: | 202011294343.5 | 申请日: | 2020-11-18 |
公开(公告)号: | CN112447267A | 公开(公告)日: | 2021-03-05 |
发明(设计)人: | 蒋瑞;温书豪;马健;赖力鹏 | 申请(专利权)人: | 深圳晶泰科技有限公司 |
主分类号: | G16C10/00 | 分类号: | G16C10/00;G06N10/00;G06Q10/10 |
代理公司: | 深圳市科吉华烽知识产权事务所(普通合伙) 44248 | 代理人: | 胡吉科 |
地址: | 518000 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子 动力学 力场 参数 拟合 工作流 控制系统 及其 控制 方法 | ||
1.分子动力学力场参数拟合工作流控制系统,其特征在于,所述的工作流控制系统运行于本地主机,主要包括以下模块:
中央控制模块,负责与用户交互、管理输入输出、实际执行工作流、按需调用另外两个模块;
本机运算模块,负责调用所有在本机上运行的计算代码或软件,将其输入输出标准化与模块化,并嵌入到工作流中;
集群任务模块,负责调用高性能计算集群来执行特定计算任务。
2.根据权利要求1所述的分子动力学力场参数拟合工作流控制系统,其特征在于,所述的中央控制模块,具体的工作流程为:
(1)工作流模板
工作流控制系统内置一个或多个针对研究人员的实际需要定制的工作流模板,包括运算任务的分步子任务定义、每步的输入参数、需要收集并提交给下一步的输出;
(2)输入输出准备
根据工作流模板的定义,处理用户提供的最初输入以及中间输出,产生计算任务各分步的输入,包括集群任务的输入;
(3)结果获取
当分步计算任务结束时,获取相应输出,格式化后暂存在本地。
3.根据权利要求1所述的分子动力学力场参数拟合工作流控制系统,其特征在于,所述的本机运算模块,包括:
(1)标准化接口,用于执行计算代码;
(2)标准化沙盒,用于调用本机上运行的其它计算软件。
4.根据权利要求1所述的分子动力学力场参数拟合工作流控制系统,其特征在于,所述的集群任务模块,具体的工作流程为:
(1)任务提交
当中央控制模块调用执行集群计算步骤时,将准备好的输入批量提交到集群,并记录集群返回的任务索引;
(2)状态监控
每隔一段时间请求任务的最新状态,直到所有任务结束运行;
(3)结果收集
收集所有成功的任务结果以及失败的任务日志,返回给中央控制模块。
5.根据权利要求1到4任一项所述的分子动力学力场参数拟合工作流控制系统的控制方法,其特征在于,包括以下步骤:
当用户输入指令并指定本地输入时,工作流控制系统开始运行;
对于选定工作流模板,工作流控制系统依次执行每个步骤:首先检查是否已有该任务的结果保存,若结果已存在则执行下一步,若结果不存在则根据上一步任务的结果生成输入文件,根据任务类型选择在本地运算或提交至计算集群,并且当计算完成后收集结果并保存;
重复上述过程,直至运行到工作流的最后一步。
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