[发明专利]肾癌和膀胱癌的风险评估装置

权利要求书

1.一种肾癌和膀胱癌的风险评估装置，其特征在于，包括：

收集装置，用于收集测试者的外泌体溶液；

核酸获取装置，用于提取所述外泌体溶液的RNA，得到样品RNA溶液；

检测装置，用于定量检测所述样品RNA溶液中目标区域，所述目标区域包括表1或表2中的全部基因；

数据获取及分析装置，用于获取所述目标区域的表达量，将所述表达量形成数据集并建立风险评估模型，

其中，所述数据获取及分析装置通过将所述数据集分为训练集和验证集，在所述训练集中使用随机森林模型得到优选集，所述优选集中的基因数小于或等于所述目标区域的基因数，将所述优选集在所述训练集中建立所述风险评估模型，通过所述风险评估模型得出所述验证集的AUC值，所述AUC值反映发生肾癌或膀胱癌的概率，肾癌的所述AUC值大于或等于90.0％时，判断发生肾癌，膀胱癌的所述AUC值大于或等于89.9％时，判断发生膀胱癌。

2.根据权利要求1所述的肾癌和膀胱癌的风险评估装置，其特征在于，所述训练集与所述验证集的数量比为4:1。

3.根据权利要求1所述的肾癌和膀胱癌的风险评估装置，其特征在于，在所述训练集中使用随机森林模型得到优选集的方法包括：

在所述随机森林模型中采用五倍交叉验证，对每一所述训练集进行交叉验证，得到交叉验证误差曲线；

对所有所述交叉验证误差曲线取平均值，得到平均曲线；

取所述平均曲线中的最小误差和所述最小误差对应的标准偏差，所述最小误差和所述标准偏差之和作为临界值；

列出每一所述训练集中误差小于所述临界值的所述目标区域，得到对应的标记集，其中，所述标记集中含有所述目标区域的数量最少的作为所述优选集。

4.根据权利要求1所述的肾癌和膀胱癌的风险评估装置，其特征在于，所述检测装置包括测序装置，所述目标区域的测序长度为120～180PE。

5.根据权利要求1所述的肾癌和膀胱癌的风险评估装置，其特征在于，所述核酸提取装置提取所述外泌体溶液中的所述样品RNA溶液的方法包括：

向所述外泌体溶液中加入600～800μl Trizol溶液，18-25℃下孵育匀浆3～5min后，加入100～220μl氯仿，晃动混匀10～20s，在2～6℃、10000～12000rpm离心10～15min，取上层澄清溶液，将上层澄清溶液进行RNA纯化，得到样品RNA溶液。

6.根据权利要求1所述的肾癌和膀胱癌的风险评估装置，其特征在于，所述检测装置为扩增装置。

7.根据权利要求6所述的肾癌和膀胱癌的风险评估装置，其特征在于，所述扩增装置为荧光定量PCR装置，所述荧光定量PCR装置对所述样品RNA溶液的扩增方法包括：

将样品RNA溶液加入qRT-PCR扩增体系中，先在30℃～50℃条件下，扩增10min～30min，再在90℃～95℃条件下，扩增2min～10min；

进一步在90℃～95℃条件下，扩增10s～30s，最后在55℃～65℃条件下，扩增30s～60s，此步骤循环30次～50次，得到PCR产物；

其中，在55℃～65℃扩增的步骤采集荧光信号。

8.根据权利要求1所述的肾癌和膀胱癌的风险评估装置，其特征在于，所述收集装置还用于对所述外泌体溶液进行前处理，所述前处理包括提纯所述外泌体溶液。