[发明专利]一种杂交捕获试剂盒及利用该试剂盒进行杂交捕获的方法在审
申请号: | 202011299951.5 | 申请日: | 2020-11-19 |
公开(公告)号: | CN112375809A | 公开(公告)日: | 2021-02-19 |
发明(设计)人: | 李芸 | 申请(专利权)人: | 天津莱贝生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6813 | 分类号: | C12Q1/6813;C12Q1/6806;C40B50/06;C12Q1/6869 |
代理公司: | 天津创信方达专利代理事务所(普通合伙) 12247 | 代理人: | 李京京 |
地址: | 300000 天津市武清区泗村店*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 杂交 捕获 试剂盒 利用 进行 方法 | ||
1.一种目标区域杂交捕获的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括封闭试剂、RNAInhibitor、杂交缓冲液、洗脱试剂及PCR扩增试剂;其中,所述封闭试剂包括市售HumanCot-1DNA、Salmon DNA及接头序列封闭试剂。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述洗脱试剂包括洗脱试剂I、洗脱试剂II及洗脱试剂III,所述洗脱试剂I由NaCl、Tris-Cl和EDTA组成,所述洗脱试剂II和洗脱试剂III均由SSC和SDS组成。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述接头序列封闭试剂为TS Mix。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Nuclease-freewater。
5.一种利用权利要求1-4任一所述试剂盒进行杂交捕获的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)封闭接头和重复序列:向待杂交的文库中加入TS Mix以封闭接头序列,加入HumanCot-1 DNA及Salmon DNA以封闭重复DNA序列;
(2)RNA探针与目标区域的结合;
(3)杂交后文库的捕获;
(4)捕获后文库的洗脱;
(5)洗脱后文库的PCR富集及磁珠纯化。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中,封闭的反应体系如下:
;
封闭的反应程序如下:
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)具体是:当反应程序进行到第三步65℃,PAUSE时,向文库混合液中加入含有RNA探针的Hybridization Mix,控制第五步65℃,HOLD的时间在8-12h,实现探针与目标区域的特异性结合;Hybridization Mix的配制体系如下:
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)包括:用洗脱试剂I清洗Dynabeads Myone Sreptavidin T1磁珠;用洗脱试剂I重新悬浮磁珠;加入杂交产物,放置在四维混匀仪上,室温混匀30min。
9.根据权利要求5或8所述的方法,其特征在于,所述步骤4是用洗脱试剂II及洗脱试剂III对捕获后的文库进行洗脱。
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