[发明专利]蛋白质亚细胞定位方法、系统、储存介质及计算机设备

权利要求书

1.一种蛋白质亚细胞定位方法，其特征在于，包括以下步骤：

S01，获取训练集，所述训练集包括根据蛋白质种类划分为若干子集的亚细胞位置数据；

S02，通过逐一对各子集执行以下步骤，获得各子集的分类器：

S021，以当前子集的亚细胞位置数据作为目标样本，以相对于当前子集的其它子集的亚细胞位置数据作为负样本，将所述目标样本以及负样本映射到特征空间中；

S022，根据预设的弹球损失函数构建针对所述目标样本以及负样本的优化问题，通过求解所述优化问题获得当前子集在所述特征空间中的超球体的球心以及半径，以所述超球体作为当前子集的分类器；

所述弹球损失函数L_τ(x，μ，R)如下：

其中，τ表示弹球损失的参数，向量x表示所述目标样本，向量x_i表示第i个所述目标样本，μ表示所述超球体的球心，R表示所述超球体的半径；

所述优化问题按以下公式表示：

其中，C表示松弛变量，C0；

在线性情况下，所述优化问题在代入所述弹球损失函数L_τ(x，μ，R)后表示为如下线性情况的二次规划问题：

s.t.||x_i-μ||²≤(1-τ)R²+ξ_i

i＝1，2，...，n；

其中，ξ_i为第i个松弛向量；n表示所述目标样本的个数；

在非线性情况下，所述优化问题在代入所述弹球损失函数L_τ(x，μ，R)后表示为如下二次规划问题：

s.t.||φ(x_i)-μ||²≤(1-τ)R²+ξ_i

i＝1，2，...，n；

其中，ξ_i为第i个松弛向量；n表示所述目标样本的个数；

S03，获取测试集，所述测试集包括未分类的亚细胞位置数据；

S04，运用各子集的分类器分别对所述测试集进行分类处理，获得所述测试集的分类结果；以所述分类结果作为对所述测试集的各项亚细胞位置数据所对应的蛋白质的预测。

2.根据权利要求1所述的蛋白质亚细胞定位方法，其特征在于，通过以下函数对所述线性情况的二次规划问题进行求解：

其中，α_i、α_j表示拉格朗日乘子，α_i＞0，a_j＞0；

3.根据权利要求1所述的蛋白质亚细胞定位方法，其特征在于，通过以下函数对所述非线性情况的二次规划问题进行求解：

其中，α_i、α_j表示拉格朗日乘子，α_i＞0，α_j＞0；

其中，核函数K(x_i，x_j)＝φ(x_i)·φ(x_j)。

4.根据权利要求2或3所述的蛋白质亚细胞定位方法，其特征在于，完成对应的二次规划问题的求解后，通过以下公式获得所述超球体的球心μ以及半径R：

其中，集合N＝{i|0＜α_i＜C}。