[发明专利]一种多位点结直肠癌甲基化检测引物、探针及试剂盒在审

专利信息
申请号: 202011321167.X 申请日: 2020-11-23
公开(公告)号: CN112266964A 公开(公告)日: 2021-01-26
发明(设计)人: 梁美;陆家雯;赖国锋;杜颜;冯雪 申请(专利权)人: 广州齐凯生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 庆之
地址: 510000 广东省广州市黄*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 多位点结 直肠癌 甲基化 检测 引物 探针 试剂盒
【权利要求书】:

1.一组特异性引物,包括用于扩增NDRG4基因、SDC2基因、PDX1基因、TFPI2基因、BMP3基因和SFRP2基因的启动子区高甲基化区域的特异性引物。

2.根据权利要求1所述的特异性引物,其特征在于,所述特异性引物的核苷酸序列如下所示:

用于扩增NDRG4基因的引物:

NDRG-F2:GAGCCGTTATTTCGTCGG(SEQ ID NO.2);

NDRG-R2:GCGTAACCGAAAATTCTAC(SEQ ID NO.5);

用于扩增BMP3基因的引物:

BMP-F1:CGTTATCACGAAGTATCACGA(SEQ ID NO.10);

BMP-R1:GAAACCGACACGAATAAACTC(SEQ ID NO.11);

用于扩增SDC2基因的引物:

SDC-F2:GAGTAGGGCGGGCGTAAG(SEQ ID NO.14);

SDC-R1:AACACACGTCGATTGAAACA(SEQ ID NO.15);

用于扩增TFPI2基因的引物:

TFPI-F2:AGGCGTTTTTTATCGCGTT(SEQ ID NO.18);

TFPI-R2:CACACACCCGTCTTACCCA(SEQ ID NO.20);

用于扩增PDX1基因的引物:

PDX-F1:ACGCGCGTTTATTATGCACGGTCCCG(SEQ ID NO.22);

PDX-R1:AATTACCTGCGATTATCGGCACAGT(SEQ ID NO.23);

用于扩增SFRP2基因的引物:

SFRP-F1:CGTTCGTAGGGTTACGATCG(SEQ ID NO.25);

SFRP-R1:ACGCGCTATGTTCGCAAATTA(SEQ ID NO.28)。

3.一组特异性探针,包括靶向NDRG4基因、SDC2基因、PDX1基因、TFPI2基因、BMP3基因和SFRP2基因的启动子区高甲基化区域的特异性探针。

4.根据权利要求3所述的特异性探针,其特征在于,所述特异性探针标记有的荧光基团和淬灭基团,所述荧光基团优选为FAM、VIC、ROX、CY5中的一种;所述淬灭基团优选为BHQ1、BHQ2中一种。

5.根据权利要求3所述的特异性探针,其特征在于,所述特异性探针的核苷酸序列如下所示:

靶向NDRG4的探针:

NDRG-P2:TTCGTTCGGGAGTTCGTTCCGCGTTTT(SEQ ID NO.8);

靶向BMP3的探针:

BMP-P1:CGAGTCGGGTTTCGTGCGTTTTCGT(SEQ ID NO.12);

靶向SDC2的探针:

SDC-P1:CGAGCACCGAGAACTCGCGTTCGCGAG(SEQ ID NO.16);

靶向TFPI2的探针:

TFPI-P1:AGCGAACCGACGAATATCGG(SEQ ID NO.21);

靶向PDX1的探针:

PDX-P1:AGCTGAACCGTTCGCAGCCGGGAGTATT(SEQ ID NO.24);

靶向SFRP2的探针:

SFRP-P1:TAATCGCGTTATCGTCGACGCGTGTATG(SEQ ID NO.30)。

6.一种检测材料,包括权利要求1或2所述的特异性引物和/或权利要求3~5任一项所述的特异性探针。

7.根据权利要求6所述的检测材料,其特征在于,还包括内参基因的检测材料,所述内参基因优选为ACTB基因。

8.一种检测试剂盒,包含权利要求6或7所述的检测材料。

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