[发明专利]一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法

权利要求书

1.一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法，其特征在于：包括有效检测人食管鳞癌组织内具核梭杆菌，所述具核梭杆菌特异性基因nusG的引物序列特征为：根据具核梭杆菌的nusG基因mRNA序列Gene ID：45633894，基因组序列为NZ_LN831027.1；

nusG正义链引物：5’-TGGTGTCATTCTTCCAAAAATATCA-3’；

nusG反义链引物：5’-AGATCAAGAAGGACAAGTTGCTGAA-3’；

具体预测步骤如下：

S1：根据该有效的nusG基因序列，通过qPCR技术检测并设定通过熔解曲线评价qPCR结果的可靠性，并取Ct值(达到设定阈值所经历的循环数)，从而检测肿瘤组织内具核梭杆菌的DNA表达；

S2：利用全外显子测序技术检测食管鳞癌组织的肿瘤突变负荷(TMB)；

S3：联合步骤S1和步骤S2的结果构建预测模型，根据Ct值和TMB值进行食管鳞癌转移情况的预测。

2.根据权利要求1所述的一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法，其特征在于：所述步骤S1中的检测肿瘤组织内具核梭杆菌的DNA表达方式中：任何Ct值低于或等于37个循环的样本都被认定为阳性；当标本的Ct值大于37时，认为阴性。

3.根据权利要求1所述的一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法，其特征在于：所述步骤S2中设定当TMB值大于或等于120时为高TMB(TMB-H)，TMB值小于120时为低TMB(TMB-L)。

4.根据权利要求1所述的一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法，其特征在于：所述步骤S3中创建的预测食管鳞癌转移模型包括食管鳞癌组织中具核梭杆菌的Ct值和食管鳞癌组织的TMB值。