[发明专利]一种检测ADGRG6高频突变位点的方法及试剂盒有效

专利信息
申请号: 202011330770.4 申请日: 2020-11-24
公开(公告)号: CN112322739B 公开(公告)日: 2023-08-15
发明(设计)人: 吴松;欧铜;徐银燕 申请(专利权)人: 深圳市罗湖区人民医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 代理人: 徐凯凯;王永文
地址: 518001 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 adgrg6 高频 突变 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种检测ADGRG6突变位点的试剂盒,其特征在于,包括chr. 6: 142,706,206 G  A突变位点的引物G  A-F,引物G  A-R及探针G  A-PF;chr. 6:142,706,209 C  T突变位点的引物C  T-R,引物C  T-F及探针C  T-PR;内参引物Control-F,内参引物Control-R及探针Control-PR;所述引物G  A-F的序列如SEQ ID.1所示;所述引物G  A-R的序列如SEQ ID.2所示;所述探针G  A-PF的序列为5’ 6FAM-CCTCTG/iXNA_T/GGTATT/iXNA_C/T/iXNA_C/CCT/iXNA_C/CAG-BHQ-1 3’,其中/iXNA_T/、/iXNA_C/及/iXNA_G/表示锁核苷酸修饰,所述iXNA为LNA;

所述引物C  T-R的序列如SEQ ID.4所示,所述引物C  T-F的序列如SEQ ID.5所示;所述探针C  T-PR的序列为5’ 6FAM-CTACTG/iXNA_G/CTAGAGT/iXNA_C/CATG/iXNA_T/GAAA/iXNA_T/ATG-BHQ-1 3’,其中/iXNA_T/、/iXNA_C/及/iXNA_G/表示锁核苷酸修饰,所述iXNA为LNA;所述内参引物Control-F的序列如SEQ ID.7所示,所述内参引物Control-R的序列如SEQ ID.8所示;所述探针Control-PR的序列为5’ 6HEX-TGTACCTTGGATTCACTGGCCTGTC-BHQ-1 3’;

所述试剂盒用于检测ADGRG6突变位点时,包括步骤:

采用所述试剂盒对待测样品进行PCR扩增,得到扩增后样品;

测量扩增后样品的ΔCt值= Ct值FAM -Ct值HEX;

若chr. 6: 142,706,206 G  A突变位点体系扩增后样品的ΔCt值14,则判定待测样品为chr. 6: 142,706,206 G  A突变位点突变型,若扩增后样品的ΔCt值14,则判定待测样品为chr. 6: 142,706,206 G  A突变位点野生型;

若chr. 6:142,706,209 C  T突变位点体系扩增后样品的ΔCt值14,则判定待测样品为chr. 6:142,706,209 C  T突变位点突变型,若扩增后样品的ΔCt值14,则判定待测样品为chr. 6:142,706,209 C  T突变位点野生型;

所述试剂盒的反应体系包括反应体系1和反应体系2,

所述反应体系1包括:

10×PCR缓冲液 5μl,

MgCl2 40mM 4μl,

dNTP 2.5mM 2.5μl,

引物GA-F 10pM 2.5μl,

引物GA-R 10pM 2.5μl,

探针GA-PR 10pM 0.5μl,

Control-F 10pM 0.2μl,

Control-R 10pM 0.2μl,

Control-PR 10pM 0.5μl,

HSTaq酶 0.2μl,

DNA模板 5μl,

添加无菌双蒸水至反应体系体积为50μl;

所述反应体系2包括:

10×PCR缓冲液 5μl,

MgCl2 40mM 4μl,

dNTP 2.5mM 2.5μl,

引物CT-F 10pM 2.5μl,

引物CT-R 10pM 2.5μl,

探针CT-PF 10pM 0.5μl,

Control-F 10pM 0.2μl,

Control-R 10pM 0.2μl,

Control-PR 10pM 0.5μl,

HSTaq酶 0.2μl,

DNA模板 5μl,

添加无菌双蒸水至反应体系体积为 50μl。

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