[发明专利]与哮喘易感性相关的SNP分子标记及检测试剂有效

专利信息
申请号: 202011344530.X 申请日: 2020-11-25
公开(公告)号: CN112795634B 公开(公告)日: 2022-08-26
发明(设计)人: 赵顺英;宋铭晶;周春菊;田静;贺薷萱;范祎慕;田宝琳;张倩倩 申请(专利权)人: 首都医科大学附属北京儿童医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 深圳国联专利代理事务所(特殊普通合伙) 44465 代理人: 晏达峰
地址: 100000 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 哮喘 感性 相关 snp 分子 标记 检测 试剂
【说明书】:

发明公开了与哮喘易感性相关的SNP分子标记及检测试剂。所述分子标记选自LGALS7基因启动子区的rs138945880、rs567785577和rs556809240;其中,rs138945880 CT基因型、rs567785577 AG基因型、rs556809240 CT基因型为哮喘易感性基因型。通过较全面地考察LGALS7基因在哮喘患儿中的调控作用,本发明首次发现LGALS7基因启动子区的3个SNP改变与哮喘易感性有关。可用于哮喘的诊断和风险预测,本发明对于深入了解哮喘的发病机制具有重要意义。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域,具体地说,涉及与哮喘易感性相关的SNP分子标记及检测试剂。

背景技术

半乳糖凝集素-7(Galectin-7,LGALS7)是抑癌基因p53诱导基因1(P53-inducedgene 1,PIG1)蛋白,前期研究发现LGALS7 mRNA及其蛋白质在哮喘患儿表达增加;LGALS7通过诱导支气管上皮细胞凋亡参与哮喘发病。但在哮喘患儿中,Galectin-7升高的调控机制不明,LGALS7诱导支气管上皮细胞凋亡的信号途径或相互作用蛋白质也未见报道。

发明内容

本发明的目的是提供与哮喘易感性相关的SNP分子标记及检测试剂。

本发明的另一目的是提供LGALS7诱导支气管上皮细胞凋亡的相关信号途径。

本发明的再一目的是提供与LGALS7互作、并可能参与细胞凋亡的蛋白。

为了实现本发明目的,第一方面,本发明提供与哮喘易感性相关的SNP分子标记,所述分子标记选自LGALS7基因启动子区的rs138945880、rs567785577和rs556809240。

其中,rs138945880CT基因型、rs567785577AG基因型、rs556809240CT基因型为哮喘易感性基因型。

本发明中,所述分子标记优选针对0-18岁中国人群。

第二方面,本发明提供与哮喘易感性相关的SNP分子标记组合,所述组合选自①~④中任一个:

①分子标记rs556809240和rs138945880;

②分子标记rs556809240和rs567785577;

③分子标记rs138945880和rs567785577;

④分子标记rs138945880、rs567785577和rs556809240。

第三方面,本发明提供用于扩增所述分子标记的引物,可同时扩增rs138945880、rs567785577和rs556809240的引物为(SEQ ID NO:1-2):

上游引物:5′-TCAGGTACCAGTCCAGGCAGGAGGTTC-3′

下游引物:5′-AAGCTCGAGGAGGAAGCCACAAAGAGGTAGAGGG-3′

第四方面,本发明提供含有所述引物的检测试剂或试剂盒。

第五方面,本发明提供所述引物在制备用于预测或筛查哮喘易感人群的产品(如检测试剂或试剂盒)中的应用。

优选地,所述哮喘易感人群为0-18岁中国人群。

第六方面,本发明提供LGALS7诱导支气管上皮细胞凋亡的相关信号途径:Galectin7分布于支气管上皮细胞的细胞内外,诱导凋亡的途径可能通过细胞内线粒体JNK、细胞色素C、Caspase-3途径以及细胞外配体识别途径。

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