[发明专利]一种基于图深度学习的EMR信息关联及演化方法有效
申请号: | 202011353177.1 | 申请日: | 2020-11-26 |
公开(公告)号: | CN112466462B | 公开(公告)日: | 2023-03-07 |
发明(设计)人: | 王华珍;刘晓聪;何霆 | 申请(专利权)人: | 华侨大学 |
主分类号: | G16H50/20 | 分类号: | G16H50/20;G16H50/70;G16H10/20;G06F40/289;G06F40/30;G06F40/242;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人: | 张松亭 |
地址: | 362000 福建省*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 学习 emr 信息 关联 演化 方法 | ||
1.一种基于图深度学习的EMR信息关联及演化方法,其特征在于,包括如下步骤:
EMR数据预处理:获取EMR数据集,对获取的EMR数据进行预处理,得到EMR的实体词典;
EMR图构建:利用word2vec方法将实体词典中的词转换为向量表示,得到对应EMR数据的EMR图的向量矩阵;选取实体词典的实体词作为EMR图的节点,实体词典中实体词的数量为EMR图节点个数最大值V_num,通过计算任意两个图节点的条件概率,获取EMR图的邻接矩阵并进行归一化,得到归一化后的EMR图的邻接矩阵;所述EMR图的向量矩阵和归一化后的EMR图的邻接矩阵构成EMR图;其中,针对EMR图中任意两个节点vi和vj,i,j=1,2,..,V_num,且i≠j,vj到vi的边权值为P(vi|vj),即vi在vj出现的条件下出现的概率,计算公式为:
EMR图深度学习模型构建:根据得到的EMR数据集对应的所有EMR图,构建出EMR图深度学习模型的输入图数据集T={Gi,i=1,2,…,n},其中Gi=(Qi,Ai)为第i份电子病历数据,n为电子病历数据的数量,Qi={q_vecoteri,i=1,2,…,V_num}为EMR图Gi的向量矩阵,Ai,i=1,2,…,n为EMR图Gi的邻接矩阵;利用图神经网络transformer模型进行EMR图深度学习,将邻接矩阵Ai作为图神经网络transformer模型的第一个自注意力模块block1的初始化矩阵M1,即Ai=M1;采用图数据集T作为图神经网络transformer模型的输入数据,将EMR的初步诊断作为图神经网络transformer模型的输出数据,对transformer模型进行训练,从而获得图深度学习模型F;
EMR信息关联及演化:将任意一条EMR图数据,将其喂入图深度学习模型F,通过模型F的第二个及其以上的自注意力模块blocki,中的注意力矩阵来构建一系列的EMR图Gi的邻接矩阵M2,…Mm,其中,M2,…Mm是由基于条件概率的邻接矩阵M1经过图深度学习得到的邻接矩阵的演化;汇集M1,M2,…Mm构建EMR图的演化序列M={Mi,i=1,2,…,m}。
2.根据权利要求1所述的基于图深度学习的EMR信息关联及演化方法,其特征在于,所述获取EMR数据集,EMR数据集包括社会人口学信息、主诉医疗文本、体格检查、实验室检查及其结果和疾病诊断。
3.根据权利要求1所述的基于图深度学习的EMR信息关联及演化方法,其特征在于,所述对获取的EMR数据进行预处理,对获取的EMR数据进行预处理包括分词、实体抽取。
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