[发明专利]一种预测宫颈鳞癌化疗疗效的标志物及其筛选方法和应用

权利要求书

1.一种预测宫颈鳞癌化疗疗效的标志物，其特征在于，所述标志物为SRSF7、SNRPB、SNRPA、SF3A2和PQBP1基因中的至少一种。

2.一种检测预测宫颈鳞癌化疗疗效标志物的试剂在制备用于预测宫颈鳞癌基于顺铂联合放化疗效果的产品中的应用，其特征在于，所述试剂为检测SRSF7、SNRPB、SNRPA、SF3A2或PQBP1基因频率或表达水平的试剂。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，检测所述基因频率的试剂包括使用免疫组库测序方法检测SRSF7、SNRPB、SNRPA、SF3A2或PQBP1基因基因频率的试剂。

4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，检测所述基因表达水平的试剂包括针对SRSF7、SNRPB、SNRPA、SF3A2或PQBP1基因的探针、引物、抗体或配体。

5.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述产品还包括RNA提取试剂、GAPDH内参引物、PCR反应液、反转录试剂、阴性对照和阳性对照。

6.一种用于宫颈鳞癌辅助诊断或疗效预测的试剂盒，其特征在于，包括用于检测SRSF7、SNRPB、SNRPA、SF3A2或PQBP1基因表达量的引物，所述引物序列为：

SRSF7-F：5’-CTATGAGTGTGGCGAAAAGGGAC-3’；

SRSF7-R：5’-GAGTATCGCCTTCCTCTGGATC-3’；

SNRPB-F：5’-TTGGCACCTTCAAGGCTTTTGAC-3’；

SNRPB-R：5’-AGACCGAGGACTCGCTTCTCTT-3’；

SNRPA-F：5’-CTGGTATCACGGAGCCTGAAGA-3’；

SNRPA-R：5’-TGAGTCGGTCTTGGCATACTGG-3’；

SF3A2-F：5’-GAAGAACCACCTGGGCTCCTAT-3’；

SF3A2-R：5’-CAGGTTGGTCTGGTGCTTCTTC-3’；

PQBP1-F：5’-ACTCCGTGGTTACCAAATCGGC-3’；

PQBP1-R：5’-CCCTGTCTAGTTTCTCATGGCTG-3’。

7.一种权利要求1所述预测宫颈鳞癌化疗疗效标志物的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)在GEO数据库中检索宫颈鳞癌放化疗相关的基因表达谱，检索到GSE56303-GPL10191、GSE56303-GPL16025和GSE56363数据集；

(2)基于检索的数据集，采用R软件对数据进行归一化处理，依据放化疗有效和放化疗无效进行分组，并采用limma软件筛选出差异基因，筛选标准为：P0.05并且log|FC|0.5；

(3)将步骤(2)中每个数据集获得的差异基因分别两两取交集基因，获得共同表达趋势的差异基因；

(4)利用DAVID工具对步骤(3)获得的共同表达趋势的差异基因进行GO和KEGG信号通路富集分析，采用ANOVA检验基因本体论和KEGG信号通路的数据间差异；

(5)利用STRING工具获得蛋白的相互作用网络，采用Cytoscape的插件MCODE得到重要的功能模块和重要基因；

(6)在TCGA数据库和HPA数据库中找出宫颈鳞癌患者验证重要基因的预后并获得目标靶基因。

8.根据权利要求7所述的筛选方法，其特征在于，所述步骤(3)共同表达趋势的差异基因为相比于放化疗无反应者显著性共同上调基因和共同下调基因。

9.根据权利要求8所述的筛选方法，其特征在于，所述步骤(4)中共同表达趋势的差异基因为共同上调基因。

10.根据权利要求9所述的筛选方法，其特征在于，所述步骤(6)获得的目标靶基因包括SRSF7、SNRPB、SNRPA、SF3A2和PQBP1基因。