[发明专利]用于龟分枝杆菌检测的试剂盒及系统

说明书

本公开涉及一种用于龟分枝杆菌检测的试剂盒及系统，该试剂盒包括用于检测分子标志物的试剂，其中，所述分子标志物包括yjcH基因、mpr基因、rrl C2638T位点和rrl G2654A位点中的至少一种。通过识别上述分子标志物，本公开能够实现龟分枝杆菌的精确检测。

技术领域

本公开涉及生物技术领域，具体地，涉及用于龟分枝杆菌检测的试剂盒、用于检测分子标志物的试剂在制备用于龟分枝杆菌检测的试剂盒中的用途以及用于龟分枝杆菌检测的系统。

背景技术

非结核分枝杆菌(Non-tuberculous Mycobacterium，NTM)是指除结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis(Mtb)complex)和麻风分枝杆菌(Mycobacteriumleprae)以外的分枝杆菌，广泛存在于自然环境中。约三分之一的NTM可引起动物或人感染，例如堪萨斯分枝杆菌、鸟分枝杆菌、胞内分枝杆菌、脓肿分枝杆菌和龟分枝杆菌等。

NTM感染常见于结构性肺部疾病患者，感染人体后，NTM多侵犯患者肺组织，导致支气管和肺泡组织发生进行性破坏，引起与肺结核相似的症状，影响患者的呼吸功能，严重时可造成宿主死亡。近年来，NTM感染率逐年上升，且多个研究表明NTM可在人与人之间传染，因此，及时且准确地进行NTM检测，具有重要的社会和临床价值。

相关技术中，NTM检测多依赖于靶基因测序和质谱检测，其中，常见的靶基因有16SrRNA、16S-23S rRNA基因间隔区(ITS)、RNA聚合酶β亚基(rpoB)、热休克蛋白65(hsp65)和DNA解旋酶(gyrA/gyrB)的编码基因、sodA基因、recA基因等基因。

然而，在实现本公开的过程中，发明人发现现有NTM检测技术的分辨率较低，无法准确分辨亲缘关系较近的NTM菌种。

发明内容

本公开的目的是解决现有NTM检测技术中存在的分辨率较低的问题，提供一种能够精确检测龟分枝杆菌的试剂盒及系统。

为了实现上述目的，第一方面，本公开提供一种用于龟分枝杆菌检测的试剂盒，该试剂盒包括用于检测分子标志物的试剂，其中，所述分子标志物包括yjcH基因、mpr基因、rrl C2638T位点和rrl G2654A位点中的至少一种。

可选地，所述用于检测分子标志物的试剂包括能够特异性扩增所述分子标志物的引物对，和/或，能够与所述分子标志物特异性杂交的探针。

可选地，所述引物对包括SEQ ID NO:1～2、SEQ ID NO:3～4、SEQ ID NO:5～6和SEQ ID NO:7～8所示引物中的至少一对。

第二方面，本公开提供用于检测分子标志物的试剂在制备用于龟分枝杆菌检测的试剂盒中的用途，所述分子标志物包括yjcH基因、mpr基因、rrl C2638T位点和rrl G2654A位点中的至少一种。

可选地，所述用于检测分子标志物的试剂，包括能够特异性扩增所述分子标志物的引物对，和/或，能够与所述分子标志物特异性杂交的探针。

可选地，所述引物对包括SEQ ID NO:1～2、SEQ ID NO:3～4、SEQ ID NO:5～6和SEQ ID NO:7～8所示引物中的至少一对。

第三方面，本公开提供用于龟分枝杆菌检测的系统，该系统包括测序装置、计算装置和输出装置；

所述测序装置用于对待测样本的总核酸进行核酸序列测序，得到总核酸序列；

所述计算装置包括存储器和处理器，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计算机程序，以实现如下判别：