[发明专利]一种可鉴定大麦籽粒糯性的KASP分子标记及其应用在审

专利信息
申请号: 202011364661.4 申请日: 2020-11-27
公开(公告)号: CN112322617A 公开(公告)日: 2021-02-05
发明(设计)人: 陈静;张紫晋;肖春生;粟永英;任益明;江迪;杨婷 申请(专利权)人: 中国科学院成都生物研究所
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6895;C12Q1/6851
代理公司: 成都坤伦厚朴专利代理事务所(普通合伙) 51247 代理人: 吴亦雨
地址: 610041 四川*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 鉴定 大麦 籽粒 kasp 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种引物组合物,其特征在于:分别延长SNP G3935前后至少40bp碱基序列后获得。

2.一种引物组合物,其特征在于:包括正向引物AL1,其序列如SEQ ID NO.3所示;正向引物AL2,其序列如SEQ ID NO.4所示;反向引物C,其序列如SEQ ID NO.5所示。

3.权利要求1或2所述引物组合物在鉴定、检测、筛选大麦籽粒糯性及培育糯性大麦品种中的应用。

4.根据权利要求3所述应用,其特征在于:以待测样品的基因组DNA为模板,利用所述引物组合物对模板进行荧光定量PCR扩增,利用扩增结果进行基因型分型。

5.根据权利要求4所述应用,其特征在于:在各引物的5’端分别添加不同的标记基团,可识别出正向引物AL2标记的标记基团的待测样品为糯性大麦。

6.根据权利要求5所述应用,其特征在于:所述标记基团为荧光修饰基团。

7.根据权利要求4所述应用,其特征在于:包括如下步骤:

(1)提取待测大麦样品DNA;

(2)取浓度为50~100ng/μL的模板DNA 1.0μL、引物混合液0.7μL、KASP Master Mix5.0μL、超纯水加至总量为10μL,进行PCR扩增反应;所述引物混合液为正向引物AL1、正向引物AL2、反向引物C的混合溶液;

PCR扩增反应条件为:95℃预变性15分钟;第一步扩增反应:95℃变性20秒,65℃梯度退火并延伸60秒,10个循环,每个循环退火及延伸的温度降低0.7℃;第二步扩增反应,94℃变性20秒,57℃退火并延伸60秒,30个循环;12℃保存。

(3)分析PCR扩增产物基因型;检测出等位位点T3935的样品为携有糯性等位类型植株。

8.根据权利要求7所述应用,其特征在于:引物混合液的制备方法为:将浓度均为10μM的正向引物AL1、正向引物AL2、反向引物C按体积比为3:3:8的比例混合。

9.一种含有权利要求1或2所述引物组合物的产品,其特征在于:用于大麦籽粒糯性的鉴定、检测、筛选,或用于培育糯性大麦品种。

10.根据权利要求9所述产品,其特征在于:所述产品为试剂盒。

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