[发明专利]云烟87的DNA指纹图谱及其应用有效

专利信息
申请号: 202011368925.3 申请日: 2020-04-27
公开(公告)号: CN112410452B 公开(公告)日: 2022-10-14
发明(设计)人: 刘楠;张威;何声宝;王英元;罗安娜;冯晓民;张晓慧;范月月 申请(专利权)人: 国家烟草质量监督检验中心
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11
代理公司: 北京瑞恒信达知识产权代理事务所(普通合伙) 11382 代理人: 张伟
地址: 450001 河南省郑州市*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 云烟 87 dna 指纹 图谱 及其 应用
【权利要求书】:

1.云烟87的DNA指纹图谱在鉴定云烟87中的应用,所述DNA指纹图谱包括101个SNP位点,所述SNP位点及该处的特异性核苷酸如下:

2.云烟87的鉴定方法,所述鉴定方法包括以下步骤:

检测待测烟草的基因组DNA中101个SNP位点处的核苷酸,并与云烟87的DNA指纹图谱中对应的101个SNP位点处的特异性核苷酸相比较,符合率≥95%时将待测烟草鉴定为云烟87,其中所述101个SNP位点以及云烟87的DNA指纹图谱中对应的101个SNP位点处的特异性核苷酸如下:

3.根据权利要求2所述的鉴定方法,其特征在于,从待测烟草的新鲜烟叶中获得所述基因组DNA。

4.根据权利要求2所述的鉴定方法,其特征在于,所述鉴定方法包括以下步骤:

(1)从待测烟草的组织样品中提取基因组DNA,以限制性内切酶SacI和MseI对基因组DNA进行酶切;

(2)将步骤(1)得到的酶切片段与测序接头相连接后纯化,选择长度在320-420bp范围内的片段,富集扩增并测序,其中采用Illumina NovaSeq测序系统,原始测序读长为Paired-end 150bp,测序数据为FASTQ格式;

(3)将步骤(2)得到的对应于权利要求2中101个SNP位点处的核苷酸与权利要求2中限定的云烟87的DNA指纹图谱中对应的101个SNP位点处的特异性核苷酸相比较,符合率≥95%时将待测烟草鉴定为云烟87。

5.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述组织样品为新鲜烟叶。

6.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(1)中,酶切体系为:

试剂 用量

DNA,≥40ng/μl 20μl

MseⅠ,10000U/ml 0.15μl

SacⅠ,10000U/ml 0.15μl

10* 缓冲液 3μl

水 加至30μl

总体积 30μl

37℃温育4h以上。

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