[发明专利]云烟87的DNA指纹图谱及其应用有效
申请号: | 202011368925.3 | 申请日: | 2020-04-27 |
公开(公告)号: | CN112410452B | 公开(公告)日: | 2022-10-14 |
发明(设计)人: | 刘楠;张威;何声宝;王英元;罗安娜;冯晓民;张晓慧;范月月 | 申请(专利权)人: | 国家烟草质量监督检验中心 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 北京瑞恒信达知识产权代理事务所(普通合伙) 11382 | 代理人: | 张伟 |
地址: | 450001 河南省郑州市*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 云烟 87 dna 指纹 图谱 及其 应用 | ||
1.云烟87的DNA指纹图谱在鉴定云烟87中的应用,所述DNA指纹图谱包括101个SNP位点,所述SNP位点及该处的特异性核苷酸如下:
。
2.云烟87的鉴定方法,所述鉴定方法包括以下步骤:
检测待测烟草的基因组DNA中101个SNP位点处的核苷酸,并与云烟87的DNA指纹图谱中对应的101个SNP位点处的特异性核苷酸相比较,符合率≥95%时将待测烟草鉴定为云烟87,其中所述101个SNP位点以及云烟87的DNA指纹图谱中对应的101个SNP位点处的特异性核苷酸如下:
。
3.根据权利要求2所述的鉴定方法,其特征在于,从待测烟草的新鲜烟叶中获得所述基因组DNA。
4.根据权利要求2所述的鉴定方法,其特征在于,所述鉴定方法包括以下步骤:
(1)从待测烟草的组织样品中提取基因组DNA,以限制性内切酶SacI和MseI对基因组DNA进行酶切;
(2)将步骤(1)得到的酶切片段与测序接头相连接后纯化,选择长度在320-420bp范围内的片段,富集扩增并测序,其中采用Illumina NovaSeq测序系统,原始测序读长为Paired-end 150bp,测序数据为FASTQ格式;
(3)将步骤(2)得到的对应于权利要求2中101个SNP位点处的核苷酸与权利要求2中限定的云烟87的DNA指纹图谱中对应的101个SNP位点处的特异性核苷酸相比较,符合率≥95%时将待测烟草鉴定为云烟87。
5.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述组织样品为新鲜烟叶。
6.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(1)中,酶切体系为:
试剂 用量
DNA,≥40ng/μl 20μl
MseⅠ,10000U/ml 0.15μl
SacⅠ,10000U/ml 0.15μl
10* 缓冲液 3μl
水 加至30μl
总体积 30μl
37℃温育4h以上。
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