[发明专利]一种与黄瓜抗靶斑病相关的SNP标记及其应用在审
申请号: | 202011372327.3 | 申请日: | 2020-11-30 |
公开(公告)号: | CN114574608A | 公开(公告)日: | 2022-06-03 |
发明(设计)人: | 张桂华;董海涛;冯婷;张文珠;庞金安 | 申请(专利权)人: | 天津德瑞特种业有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 魏少伟 |
地址: | 300384 天津市西青区华苑*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 黄瓜 抗靶斑病 相关 snp 标记 及其 应用 | ||
1.黄瓜抗病分子标记或检测所述黄瓜抗病分子标记的物质在检测或辅助检测黄瓜靶斑病抗性中的应用;所述黄瓜抗病分子标记为对应于黄瓜基因组中序列表中序列4的第54位所示的核苷酸,所述黄瓜抗病分子标记为A或G。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述检测所述黄瓜抗病分子标记的物质为CsSNP4引物组,所述CsSNP4引物组由名称分别为F1、F2和R的单链DNA组成;
所述F1为(b1)或(b2):
(b1)序列表的序列1的第22-47位所示的单链DNA;
(b2)将序列1的第22-47位经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加得到的单链DNA;
所述F2为(b3)或(b4):
(b3)序列表的序列2的第22-47位所示的单链DNA;
(b4)将序列2的第22-47位经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加得到的单链DNA;
所述R为序列表的序列3所示的单链DNA。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:(b2)为序列表中序列1所示的单链DNA;(b4)为序列表中序列2所示的单链DNA。
4.黄瓜基因型的检测方法,所述基因型为AA基因型、AG基因型和GG基因型,所述方法包括:检测待测黄瓜染色体中对应于序列表中序列4的第54位的核苷酸,如所述待测黄瓜两条染色体均为下述g1)的染色体,所述待测黄瓜为AA基因型黄瓜;如所述待测黄瓜两条染色体均为下述g2)的染色体,所述待测黄瓜为GG基因型黄瓜;如所述待测黄瓜两条染色体中一条为下述g1)的染色体,另一条为下述g2)的染色体,所述待测黄瓜为AG基因型黄瓜;
g1)对应于序列表中序列4的第54位的核苷酸为A;
g2)对应于序列表中序列4的第54位的核苷酸为G。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:检测待测黄瓜染色体中对应于序列表中序列4的第54位的核苷酸采用权利要求2或3中所述CsSNP4引物组进行。
6.检测黄瓜靶斑病抗性的方法,包括:按照权利要求4或5所述的方法检测待测黄瓜的基因型,AA基因型待测黄瓜的靶斑病抗性高于或候选高于GG基因型黄瓜,AG基因型待测黄瓜的靶斑病抗性高于或候选高于GG基因型黄瓜。
7.黄瓜育种方法,包括:按照权利要求4或5所述的方法检测黄瓜的基因型,选择AA基因型或AG基因型黄瓜作为亲本进行育种。
8.权利要求1中所述黄瓜抗病分子标记。
9.具有如下Y1)-Y4)中任一用途的物质,包括权利要求2或3中所述CsSNP4引物组:
Y1)检测黄瓜抗病分子标记;
Y2)制备检测黄瓜抗病分子标记的产品;
Y3)检测或辅助检测黄瓜靶斑病抗性;
Y4)制备检测或辅助检测黄瓜靶斑病抗性产品。
10.下述任一应用:
H1)权利要求1中所述黄瓜抗病分子标记在黄瓜育种中的应用;
H2)检测权利要求1中所述黄瓜抗病分子标记的物质在黄瓜育种中的应用;
H3)检测权利要求1中所述黄瓜抗病分子标记的物质在制备检测或辅助检测黄瓜靶斑病抗性产品中的应用;
H4)权利要求4或5所述的方法在检测或辅助检测黄瓜靶斑病抗性中的应用。
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