[发明专利]基于python的二代测序样本混样方法、应用、设备、计算机可读存储介质

权利要求书

1.一种基于python的二代测序样本混样方法，其特征在于，所述混样方法包括如下步骤：

步骤1，文件读取并解析：所述文件为含有二代测序样本基本信息的标准格式excel表格，并自动解析多个表单，将表单数据分类成常规样品数据和补测样品数据；

步骤2，样品排序到流通槽：所述样品为待测序的核酸样本，将其依次填充到流通槽；所述流通槽需保持完整；所述完整的条件为确保同一条流通槽的接头名称不重复；和/或，数据总量不低于最低下限和不高于最高上限；和/或，补测样品数不超过上限；和/或，选择剩余样本数最少的排序组合方式；

步骤3，样品添加接头序列：所述接头序列为根据样本接头名称判断类型，并通过区分单双端接头进行查询获得的唯一对应序列；

步骤4，计算样本混样体积：所述混样体积为每条合格的流通槽，根据其中每个样品的数据量计算保持总体积趋近上限的最优混样体积；所述最优混样体积为大于下限总体积V_min且小于上限总体积V_max的最大正整数T；所述正整数T满足公式：

其中，n表示一条流通槽中的样本数，m_n表示该样品的数据量，c_n表示该样品的文库浓度；

根据T值计算出各样本混样体积v_n，其公式为：

其中，n表示一条流通槽中的样本数，m_n表示该样品的数据量，c_n表示该样品的文库浓度；

步骤5，输出混样表格：所述混样表格为拆分合格和非合格的流通槽数据，并进行自动输出后导出的同一excel表格。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述二代测序样本基本信息包含：编号、序号、样本分析名、样品名称、接头、数据量/G、合同号、任务单号、物种、项目类型、文库浓度、混样体积、建库人和备注。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤2中，所述数据总量的上限为150G，下限为90G。

4.一种设备，其特征在于，包括：存储器和处理器；

所述存储器上存储有计算机程序，当所述计算机程序被所述处理器执行时，实现如权利要求1-3之任一项所述的方法。

5.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时，实现如权利要求1-3之任一项所述的方法。