[发明专利]用于来航鸡鉴定的芯片、引物组合、试剂盒及方法

说明书

本发明筛选得到了关于来航鸡的多个品种特异性遗传位点，包括多个特异性SNP位点和一个特异性INDEL位点。本发明首次筛选到关于来航鸡的特异性INDEL位点，且所述INDEL位点用于来航鸡品种鉴定率分别高达96.67％，能够实际有效地将来航鸡鉴定出来。同时，本发明筛选得到的特异性SNP位点对来航鸡的鉴定也具有较高的鉴定率。因此，将本发明所述特异性遗传位点进行组合，可有效用于来航鸡的鉴定。本发明所述特异性遗传位点对来航鸡及非来航鸡均具有较高的鉴定率，鉴定结果更为可靠。本发明还提供了各特异性遗传位点的检测引物及其组合，所述引物特异性强，准确率高，更有利于大规模推广用于来航鸡的鉴定。

技术领域

本发明属于生物技术、遗传育种领域，具体涉及一种用于来航鸡鉴定的芯片、引物组合、试剂盒及方法。

背景技术

来航鸡是蛋用型鸡品种，原产意大利。19世纪中叶由意大利来航港传往国外，因而得名。现已在全世界普及，成为蛋用鸡有名的高产品种。来航鸡鸡体轻秀，冠大，母鸡冠多倒向一侧。耳垂、喙、脚和皮肤黄色，产蛋后因色素减退而呈白色。全身羽毛紧密洁白。标准体重成年公鸡2.7千克，母鸡2千克，蛋壳白色。性情活泼，体质强健，无就巢性，早熟，产蛋量高，耗料少。为稳定来航鸡品质，也为了解决品种认定、知识产权纠纷，需要一种对来航鸡种进行有效鉴定的方法。

发明内容

本发明主要目的是提供一种用于来航鸡鉴定的芯片、引物组合、试剂盒及其方法，为来航鸡品种的鉴定提供技术支持。

为实现上述目的，本发明采用以下技术方案：

本发明提供用于来航鸡种鉴定的特异性遗传位点，其包括以下所述特异性SNP位点：

LH_tag1位于鸡1号染色体183632213处，基因DYNC2H1第43外显子，来航鸡基因型为GG；

LH_tag2位于鸡1号染色体92665001处，基因LOC112530473的上游，来航鸡基因型为TT；

LH_tag3位于鸡2号染色体62893395处，基因ADTRP第1内含子，来航鸡基因型为CC；

LH_tag4位于鸡3号染色体103905207处，基因KLHL29第6内含子，来航鸡基因型为GG；

LH_tag5位于鸡5号染色体56157392处，基因PELI2第1内含子，来航鸡基因型为CC；

LH_tag6位于鸡7号染色体11588952处，基因CDK15第4内含子，来航鸡基因型为AA；

LH_tag7位于鸡10号染色体20503881处，基因VPS33B第10内含子，来航鸡基因型为GG；

LH_tag8位于鸡11号染色体16344468处，基因CDH13第9外显子，来航鸡基因型为AA；

LH_tag9位于鸡13号染色体18049223处，基因ARHGAP26第15内含子，来航鸡基因型为GG；

LH_tag10位于鸡20号染色体5984004处，基因SULF2第3内含子，来航鸡基因型为AA；

LH_tag11位于鸡21号染色体4896455处，基因CDA的UTR5区域，来航鸡基因型为TT；

LH_tag12位于鸡24号染色体3222659处，基因UBASH3B的上游，来航鸡基因型为GG。

LH_tag13位于鸡21号染色体3603551处，基因DAP3第2内含子，来航鸡基因型为CC；

LH_tag15位于鸡33号染色体5790191处，基因SMARCD1第9内含子，来航鸡基因型为CC；