[发明专利]具有DNA聚合酶活性的多肽、重组载体及其制备方法与应用有效
申请号: | 202011411677.6 | 申请日: | 2020-12-05 |
公开(公告)号: | CN112899253B | 公开(公告)日: | 2023-01-31 |
发明(设计)人: | 尚午;艾力克斯·诺维科夫 | 申请(专利权)人: | 南京普济生物有限公司 |
主分类号: | C12N9/12 | 分类号: | C12N9/12;C12N15/54;C12N15/10;C12P19/34 |
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地址: | 210046 江苏省南京市江北新区新锦湖路*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 具有 dna 聚合 活性 多肽 重组 载体 及其 制备 方法 应用 | ||
本发明属于生物工程领域,具体涉及具有DNA聚合酶活性的多肽、重组载体及其制备方法与应用。本发明的DNA聚合酶的氨基酸序列包括如SEQ ID NO:2所示和SEQ ID NO:3所示;编码所述DNA聚合酶的核苷酸序列包括如SEQ ID NO:1所示。同时,本发明提供一种包含如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的重组载体及其编码的DNA聚合酶、重组载体的制备方法和应用方法。本发明提供的DNA聚合酶活性的多肽、重组载体及其制备方法与应用,可在血清或土壤等样本中进行直接的聚合酶链式反应时,对样本溶液中抑制物的耐受性大幅度提高,可在样本溶液中直接有效地完成聚合酶链式反应,检测目标基因序列。
技术领域
本发明属于生物工程领域,具体涉及具有DNA聚合酶活性的多肽、重组载体及其制备方法与应用。
背景技术
DNA聚合酶在细胞中的功能是作为负责DNA合成的酶。在体内,DNA聚合酶参与一系列DNA合成过程,包括DNA复制、DNA修复、重组和基因扩增。在体外,DNA聚合酶在有金属活化剂存在的情况下,以被复制的DNA模板或多核苷酸模板支配的顺序聚合脱氧核糖核苷三磷酸。在聚合酶链式扩增反应中,DNA聚合酶是不可缺少的组分。DNA聚合酶在扩增反应中的作用很关键,被广泛应用于分子诊断、大规模平行测序等检测应用中。DNA聚合酶性能会直接影响扩增效率、灵敏度、保真性等。由于聚合酶链式反应方便、快捷、准确地大规模复制目的基因片段的能力,在生命科学研究与相关领域,如医学检测、感染性疾病检测、法医学检测等,成为了无法取代的技术手段。但是,这些研究应用于体液时,多是基于将样本中的DNA提取纯化之后,然后才能进行后续的PCR扩增反应。因此,如何在体液中直接进行目标DNA序列的直接扩增和鉴定,这一类的DNA聚合酶是行业亟需开发的一类产品。
对于传统的聚合酶链式反应,其将样本中的DNA提取纯化之后进行扩增,这种扩增技术并不适用于一些场景的实际应用,譬如在血清或土壤等样本,这些应用场景涉及的血液或土壤等样本,需要对样本的DNA直接测定,而非提取DNA后进行聚合酶链式反应,而且提取纯化DNA消耗大量的时间,同时可能导致目的基因的丢失的现象;但是,未经DNA提取纯化的样本中含有很多抑制剂会严重抑制聚合酶链式反应,通过降低酶的延伸速度。因此,亟需开发一种能够用于直接扩增样本存在的DNA的DNA聚合酶。
因此,有必要提供改进的技术方案以克服现有技术中存在的技术问题。
发明内容
为解决现有技术存在的问题,本发明提供一种具有DNA聚合酶活性的多肽、重组载体及其制备方法与应用,可在血清或土壤等样本中进行直接的聚合酶链式反应时,对样本溶液中抑制物的耐受性大幅度提高,可在样本溶液中直接有效地完成聚合酶链式反应,检测目标基因序列。对血清或土壤等样本溶液浓度的检测耐受度可达到60%以上,远高于行业内最好的检测耐受性为30%。
本发明第一方面提供一种具有DNA聚合酶活性的多肽,所述多肽具有如下所示的氨基酸序列:
(1)氨基酸序列包括SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示的序列;或
(2)氨基酸序列包括序列A和序列B,序列A与(1)中SEQ ID NO:2序列具有至少70%序列同一性,序列B与(1)中SEQ ID NO:3序列具有至少70%序列同一性。
优选地,序列A与(1)中SEQ ID NO:2序列具有至少80%序列同一性,序列B与(2)中SEQ ID NO:3序列具有至少80%序列同一性。更优选地,序列A与(1)中SEQ ID NO:2序列具有至少90%序列同一性,序列B与(2)中SEQ ID NO:3序列具有至少90%序列同一性。更优选地,序列A与(1)中SEQ ID NO:2序列具有至少95%序列同一性,序列B与(2)中SEQ ID NO:3序列具有至少95%序列同一性。更优选地,序列A与(1)中SEQ ID NO:2序列具有至少98%序列同一性,序列B与(2)中SEQ ID NO:3序列具有至少98%序列同一性。
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