[发明专利]一种如皋黄鸡的鉴定方法在审
| 申请号： | 202011417130.7 | 申请日： | 2020-12-04 |
| 公开（公告）号： | CN112501309A | 公开（公告）日： | 2021-03-16 |
| 发明（设计）人： | 胡玉萍;王克华;曲亮;窦套存;卢建;马猛 | 申请（专利权）人： | 江苏省家禽科学研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 成都东恒知盛知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51304 | 代理人： | 何健雄;廖祥文 |
| 地址： | 225125 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 如皋 鉴定 方法 | ||
1.一种如皋黄鸡鉴定的方法，其特征在于，包括鉴定以下特异性INDEL位点：
RG_tag2位于2号染色体122672840处，基因CA13与基因CA3A之间，如皋黄鸡基因型为插入一段序列：ATTT//ATTT。
2.根据权利要求1所述方法，其特征在于，还包括鉴定以下任意一种或几种特异性SNP位点：
RG_tag1位于2号染色体60449199处，KIF13A基因第2内含子，如皋黄鸡基因型为CC；
RG_tag3位于3号染色体33169622处，基因CRIM1与基因SULT6B1之间，如皋黄鸡基因型为AA；
RG_tag4位于3号染色体38660504处，SLC35F3基因第2内含子，如皋黄鸡基因型为GG；
RG_tag5位于4号染色体4196467处，基因FHL1的5‘UTR区以及基因SLC9A6的3’UTR区，如皋黄鸡基因型为GG；
RG_tag6位于5号染色体38292725处，PROX2的基因UTR3区，如皋黄鸡基因型为TT；
RG_tag7位于5号染色体49784217处，CINP基因第2内含子，如皋黄鸡基因型为CC；
RG_tag8位于8号染色体29949231处，TNNI3K基因第3内含子，如皋黄鸡基因型为CC；
RG_tag9位于10号染色体3397646处，基因LINGO1与基因HMG20A之间，如皋黄鸡基因型为GG；
RG_tag10位于24号染色体4938416处，基因CADM1与基因LOC770165之间，如皋黄鸡基因型为GG；
RG_tag11位于28号染色体3340013处，THOP1基因第2内含子，如皋黄鸡基因型为CC；
RG_tag12位于Z号染色体9794706处，基因ZFR2与基因SUB1之间，如皋黄鸡基因型为TT；
RG_tag13位于Z号染色体19199901处，ZSWIM6基因第12内含子，如皋黄鸡基因型为AA；
RG_tag14位于Z号染色体56669873处，PRRC1基因第2内含子，如皋黄鸡基因型为TT。
3.根据权利要求1所述方法，其特征在于，鉴定所述RG_tag2位点所用引物RG_P2f和RG_P2r：
RG_P2f：GAACTCCTCCATCCTCCT；
RG_P2r：AGCAGAATCCAGCACATC。
4.根据权利要求2所述方法，其特征在于，鉴定以下特异性SNP位点：RG_tag1，RG_tag3，RG_tag4，RG_tag5，RG_tag6，RG_tag7，RG_tag8，RG_tag14。
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