[发明专利]用于济宁百日鸡鉴定的芯片、引物组合、试剂盒及其鉴定方法

说明书

本发明涉及生物技术、遗传育种领域，具体涉及一种鉴定济宁百日鸡的引物组合、试剂盒及方法。本发明首次提供了济宁百日鸡的特异性遗传位点，所述特异性遗传位点包括SNP位点和INDEL位点。本发明提供的遗传位点特异性高，每个位点济宁百日鸡的鉴定率均在83.33％以上，因此，以本发明提供的特异性遗传位点组合进行济宁百日鸡的鉴定，准确性更高。本发明为今后济宁百日鸡品种资源保护与鉴定、食品溯源提供支撑。

技术领域

本发明涉及生物技术、遗传育种领域，具体涉及一种鉴定济宁百日鸡的芯片、引物组合、试剂盒及方法。

背景技术

济宁百日鸡，中心产区位于山东省济宁市郊，该品种优秀个体百日龄左右产蛋，由此得名“百日鸡”。济宁百日鸡是我国著名蛋用型地方鸡品种，具有耐粗、抗病、觅食力强、早熟的特点，是培育高产、早熟、蛋用型鸡种的优良素材。近年来，随着高产商品化品种的冲击及地方鸡种资源保护意识的缺乏，济宁百日鸡已濒临灭绝。为更好的了解和保护这一宝贵的品种资源，提供一种能够有效准确鉴定济宁百日鸡品种的产品及方法是非常有必要的。

发明内容

本发明主要目的是提供一种用于济宁百日鸡鉴定的芯片、引物组合、试剂盒及其方法，为济宁百日鸡品种的鉴定提供技术支持。

为实现上述目的，本发明采用以下技术方案：

本发明目的之一提供一组济宁百日鸡特异性遗传位点，所述济宁百日鸡特异性遗传位点包括：

JB_tag1位于鸡1号染色体91173104处，基因ARL13B第11内含子，济宁百日鸡基因型为TT；

JB_tag2位于鸡3号染色体102765389处，基因TDRD15与基因KLHL29之间，济宁百日鸡基因型为TT；

JB_tag3位于鸡4号染色体5445667处，基因PCDH19与基因DIAPH2之间，济宁百日鸡基因型为CC；

JB_tag4位于鸡5号染色体46716676处，基因PAPOLB与基因VRK1之间，济宁百日鸡基因型为GG；

JB_tag5位于鸡9号染色体12646942处，基因DLG1第2内含子，济宁百日鸡基因型为GG；

JB_tag6位于鸡12号染色体4966471处，基因VGLL4第2内含子，济宁百日鸡基因型为TT；

JB_tag7位于鸡18号染色体3243101处，基因TBCD第7内含子，济宁百日鸡基因型为TT；

JB_tag8位于鸡22号染色体3670686处，基因TMEM127的UTR3区域，济宁百日鸡基因型为CC；

JB_tag9位于鸡27号染色体6389262处，基因SKAP1第4内含子，济宁百日鸡基因型为CC；

JB_tag10位于鸡Z染色体73463410处，基因CARTPT与基因KCNN2之间，济宁百日鸡基因型为GG；

JB_tag11位于鸡7号染色体26300021处，基因IQCB1的下游区域，济宁百日鸡基因型为GG；

JB_tag12位于鸡8号染色体3987620处，基因RGS13第1内含子，济宁百日鸡基因型为GG；

JB_tag13位于鸡9号染色体20816210处，基因PDCD10与基因ZBBX之间，济宁百日鸡基因型为AA；

JB_tag14位于鸡16号染色体2100351处，基因MICA第1内含子，济宁百日鸡基因型为--(突变基因型型为插入T)；

JB_tag15位于鸡Z染色体81084550处，基因ZNF608与基因LOC112530693之间，济宁百日鸡基因型为AA。