[发明专利]一种基于点亮型RNA适体的CRISPR-Cas13核酸检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 202011436758.1 申请日: 2020-12-09
公开(公告)号: CN112609010B 公开(公告)日: 2023-03-10
发明(设计)人: 邓锐杰;张婷 申请(专利权)人: 四川大学
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6813;C12Q1/06;C12R1/085;C12R1/19;C12R1/42
代理公司: 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 代理人: 李高峡;张娟
地址: 610000 四川*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 点亮 rna crispr cas13 核酸 检测 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种基于点亮型RNA适体的CRISPR-Cas13核酸检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括:

(1)点亮型RNA适体或其DNA模板;所述点亮型RNA适体为Broccoli;

(2)Cas13蛋白;

(3)crRNA或其DNA模板;

(4)核酸染料;所述核酸染料为DFHBI-1T;

当试剂盒包括第(1)和/或第(3)项的DNA模板时,使用前需要将DNA模板转录成RNA;

所述点亮型RNA适体可特异性结合核酸染料并使其发射荧光,点亮型RNA适体如果被Cas13蛋白剪切,将无法与核酸染料结合,则荧光淬灭;

所述crRNA能与Cas13结合后形成Cas13-crRNA复合物,且形成Cas13-crRNA复合物后,在crRNA的向导序列与靶标RNA形成双链的情况下能激活Cas13蛋白的酶切活性;

所述试剂盒是检测蜡样芽孢杆菌RNA的试剂盒,其crRNA的序列如SEQ ID NO.1所示;

或,所述试剂盒是检测沙门氏菌RNA的试剂盒,其crRNA的序列如SEQ ID NO.2所示;

或,所述试剂盒是检测大肠杆菌RNA的试剂盒,其crRNA的序列如SEQ ID NO.3所示。

2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述crRNA的锚定序列如SEQ ID NO.13所示。

3.一种定性检测RNA样本中靶标RNA的方法,其特征在于:所述方法为非诊断和治疗目的,该方法包括如下步骤:

1)在RNA样本中加入权利要求1或2所述试剂盒的点亮型RNA适体、核酸染料,检测荧光;

2)加入权利要求1或2所述试剂盒的crRNA和Cas13蛋白的混合物;

3)检测荧光;

当步骤3)检测的荧光明显弱于步骤1)的荧光,则表示检测到了靶标RNA。

4.一种检测RNA样本中靶标RNA的含量的方法,其特征在于:所述方法为非诊断和治疗目的,该方法包括如下步骤:

1)准备靶标RNA的标准品;

2)向标准品加入权利要求1 或2所述试剂盒的点亮型RNA适体、crRNA和核酸染料、Cas13蛋白,在核酸染料的激发光下检测荧光,绘制标准曲线;

3)向RNA样本中加入权利要求1或2所述试剂盒的点亮型RNA适体、crRNA和核酸染料、Cas13蛋白,在核酸染料的激发光下检测荧光,代入标准曲线,得到靶标RNA浓度。

5.如权利要求4所述的方法,其特征在于:所述crRNA与Cas13的摩尔比为(1:0.25)~(1:2)。

6.如权利要求5所述的方法,其特征在于:所述crRNA与Cas13的摩尔比为(1:0.25)~(1:1)。

7.如权利要求5所述的方法,其特征在于:所述crRNA与Cas13的摩尔比为1:1。

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