[发明专利]一种基于点亮型RNA适体的CRISPR-Cas13核酸检测试剂盒有效
申请号: | 202011436758.1 | 申请日: | 2020-12-09 |
公开(公告)号: | CN112609010B | 公开(公告)日: | 2023-03-10 |
发明(设计)人: | 邓锐杰;张婷 | 申请(专利权)人: | 四川大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6813;C12Q1/06;C12R1/085;C12R1/19;C12R1/42 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李高峡;张娟 |
地址: | 610000 四川*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 点亮 rna crispr cas13 核酸 检测 试剂盒 | ||
1.一种基于点亮型RNA适体的CRISPR-Cas13核酸检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括:
(1)点亮型RNA适体或其DNA模板;所述点亮型RNA适体为Broccoli;
(2)Cas13蛋白;
(3)crRNA或其DNA模板;
(4)核酸染料;所述核酸染料为DFHBI-1T;
当试剂盒包括第(1)和/或第(3)项的DNA模板时,使用前需要将DNA模板转录成RNA;
所述点亮型RNA适体可特异性结合核酸染料并使其发射荧光,点亮型RNA适体如果被Cas13蛋白剪切,将无法与核酸染料结合,则荧光淬灭;
所述crRNA能与Cas13结合后形成Cas13-crRNA复合物,且形成Cas13-crRNA复合物后,在crRNA的向导序列与靶标RNA形成双链的情况下能激活Cas13蛋白的酶切活性;
所述试剂盒是检测蜡样芽孢杆菌RNA的试剂盒,其crRNA的序列如SEQ ID NO.1所示;
或,所述试剂盒是检测沙门氏菌RNA的试剂盒,其crRNA的序列如SEQ ID NO.2所示;
或,所述试剂盒是检测大肠杆菌RNA的试剂盒,其crRNA的序列如SEQ ID NO.3所示。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述crRNA的锚定序列如SEQ ID NO.13所示。
3.一种定性检测RNA样本中靶标RNA的方法,其特征在于:所述方法为非诊断和治疗目的,该方法包括如下步骤:
1)在RNA样本中加入权利要求1或2所述试剂盒的点亮型RNA适体、核酸染料,检测荧光;
2)加入权利要求1或2所述试剂盒的crRNA和Cas13蛋白的混合物;
3)检测荧光;
当步骤3)检测的荧光明显弱于步骤1)的荧光,则表示检测到了靶标RNA。
4.一种检测RNA样本中靶标RNA的含量的方法,其特征在于:所述方法为非诊断和治疗目的,该方法包括如下步骤:
1)准备靶标RNA的标准品;
2)向标准品加入权利要求1 或2所述试剂盒的点亮型RNA适体、crRNA和核酸染料、Cas13蛋白,在核酸染料的激发光下检测荧光,绘制标准曲线;
3)向RNA样本中加入权利要求1或2所述试剂盒的点亮型RNA适体、crRNA和核酸染料、Cas13蛋白,在核酸染料的激发光下检测荧光,代入标准曲线,得到靶标RNA浓度。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于:所述crRNA与Cas13的摩尔比为(1:0.25)~(1:2)。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于:所述crRNA与Cas13的摩尔比为(1:0.25)~(1:1)。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于:所述crRNA与Cas13的摩尔比为1:1。
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